Gen
SETX
senataxin
- HGNC 445↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000107290↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 23064↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 9q34.13
- Koordinater
- Kromosom 9: 132 261 356–132 354 986 (GRCh38)
- Exoner
- 26 exoner på 93,6 kb
- Protein
- 2 677 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- KIAA0625, AOA2, Sen1, STEX
- Tidigare symboler
- ALS4, SCAR1
- MANE Select-transkript
- ENST00000224140.6NM_015046.7
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SETX, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Amyotrofisk lateralskleros (ALS)
- Amyotrofisk lateralskleros
En neurodegenerativ sjukdom som drabbar övre och nedre motoriska nervceller, i både sporadisk och familjär form.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) vid SOD1-ALS; ASO-studier för C9orf72 och FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (natriumfenylbutyrat-taurursodiol); multidisciplinär vård på ALS-mottagning; andningsstöd; genetisk rådgivning för familjemedlemmar
Charcot-Marie-Tooth-sjukdom
- Distal hereditär motorisk neuropati
Ärftliga neuropatier som främst påverkar motoriska nerver och ger svaghet och muskelatrofi i händer och fötter, inklusive SORD-relaterad neuropati.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
DNA-reparationssjukdom
- Autosomalt recessiv
En sjukdom som bygger på en störning i DNA-reparationen.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Autosomala recessiva cerebellära ataxier (inkl. CANVAS och AVED)
- Autosomal recessiv cerebellär ataxiAutosomalt recessiv
En av 57 gener kopplade till den
En grupp recessivt nedärvda ataxier som orsakas av biallleliska varianter i gener som RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 och SYNE1.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Ataxi med vitamin E-brist (TTPA) kan behandlas med vitamin E-tillskott. Andra former behandlas med sjukgymnastik och symtomlindrande vård, och släktingar kan erbjudas bärarprov.
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är SETX uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 11,1 kb av genens 93,6 kb, och 8 034 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SETX
86
positioner i SETX där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 93,6 kb av SETX, med introner inräknade, inte bara de 11,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Delar 2 tillstånd
- DCTN1dynactin subunit 1Delar 2 tillstånd
- SIGMAR1sigma receptor chaperone 1Delar 2 tillstånd
- TDP1tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1Delar 2 tillstånd
- AHI1Abelson helper integration site 1Delar 1 tillstånd
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Delar 1 tillstånd
- ANGangiogeninDelar 1 tillstånd
- ANO10anoctamin 10Delar 1 tillstånd
- ANXA11annexin A11Delar 1 tillstånd
- APTXaprataxinDelar 1 tillstånd
- ATCAYATCAY kinesin light chain interacting caytaxinDelar 1 tillstånd
- ATG7autophagy related 7Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SETX
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SETX kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Degeneration of anterior horn cells
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of the spinal cord
- Difficulty articulating speech
- Diminished deep tendon reflex
- Impaired proprioception
- Peripheral axonal neuropathy
- Absent reflexes
Visa ytterligare 34 egenskaper
- Ataxia
- Cerebellar vermis atrophy
- Inability to coordinate movements when walking
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormality of balance
- Babinski sign
- Decreased touch sensation in extremities
- Somatic sensory dysfunction
- Tremor
- Abnormal gait
- Chorea
- Choreoathetosis
- Clonus
- Decreased reflex response
- Dystonia
- Head tremor
- Postural tremor
- Abnormal lower motor neuron morphology
- Axonal degeneration
- Chronic axonal neuropathy
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Diffuse axonal swelling
- Impaired distal vibration sensation
- Increased reflexes
- Limb ataxia
- Lou Gehrig's disease
- Pallor of dorsal columns of the spinal cord
- Peripheral axonal degeneration
- Peripheral nerve disease
- Pontocerebellar atrophy
- Progressive gait ataxia
- Twitching
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SETX-genen: senataxin. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/setx
Dante Labs. SETX-genen: senataxin [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/setx
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor