Gen
ATG7
autophagy related 7
- HGNC 16935↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000197548↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 10533↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3p25.3
- Koordinater
- Kromosom 3: 11 272 397–11 557 665 (GRCh38)
- Exoner
- 21 exoner på 285,3 kb
- Protein
- 703 aminosyror
- Även känd som
- GSA7, DKFZp434N0735
- Tidigare symboler
- APG7L
- MANE Select-transkript
- ENST00000693202.1NM_001349232.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atg7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs ATG7, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Autosomala recessiva cerebellära ataxier (inkl. CANVAS och AVED)
- Autosomal recessiv cerebellär ataxiAutosomalt recessiv
En av 57 gener kopplade till den
En grupp recessivt nedärvda ataxier som orsakas av biallleliska varianter i gener som RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 och SYNE1.
- ClinGen bedömer kopplingen som stark
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Ataxi med vitamin E-brist (TTPA) kan behandlas med vitamin E-tillskott. Andra former behandlas med sjukgymnastik och symtomlindrande vård, och släktingar kan erbjudas bärarprov.
Så är ATG7 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5,3 kb av genens 285,3 kb, och 2 112 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av ATG7
3Låg
Hur svår ATG7 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av ATG7s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.4,4 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.23 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
4
positioner i ATG7 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 285,3 kb av ATG7, inklusive introner, inte bara de 5,3 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AHI1Abelson helper integration site 1Delar 1 tillstånd
- ANO10anoctamin 10Delar 1 tillstånd
- ATCAYATCAY kinesin light chain interacting caytaxinDelar 1 tillstånd
- ATP8A2ATPase phospholipid transporting 8A2Delar 1 tillstånd
- CA8carbonic anhydrase 8 (inactive)Delar 1 tillstånd
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ADelar 1 tillstånd
- CEP290centrosomal protein 290Delar 1 tillstånd
- CEP41centrosomal protein 41Delar 1 tillstånd
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Delar 1 tillstånd
- COQ8Acoenzyme Q8ADelar 1 tillstånd
- CSPP1centrosome and spindle pole associated protein 1Delar 1 tillstånd
- CTDP1CTD phosphatase 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till ATG7
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som ATG7 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ATG7-genen: autophagy related 7. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/atg7
Dante Labs. ATG7-genen: autophagy related 7 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/atg7
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor