Gen
PKP2
plakophilin 2
- HGNC 9024↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000057294↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 5318↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 12p11.21
- Współrzędne
- Chromosom 12: 32 790 755–32 896 777 (GRCh38)
- Eksony
- 13 eksonów na odcinku 106 kb
- Białko
- 837 aminokwasów
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000340811.9NM_001005242.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj PKP2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Kardiomiopatia arytmogenna
- Arytmogenna kardiomiopatia prawej komory (ARVC)
Postępujące zastępowanie mięśnia sercowego tkanką tłuszczową i bliznowatą, przede wszystkim w prawej komorze, prowadzące do komorowych zaburzeń rytmu. Zazwyczaj wywoływane przez warianty w genach desmosomów PKP2, DSP, DSG2, DSC2 i JUP lub w genach TMEM43, PLN albo DES.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Rozpoznanie uzasadnia regularne monitorowanie rytmu serca, zalecenia dotyczące ograniczenia intensywnego wysiłku wytrzymałościowego, decyzje dotyczące wszczepialnych defibrylatorów oraz badania krewnych.
Budowa genu PKP2
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,2 kb z 106 kb genu; 2514 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje PKP2
278
pozycje w PKP2, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
23 z nich (8,3%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (10 miejsc)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (13 miejsc)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 106 kb genu PKP2, łącznie z intronami, a nie tylko 4,2 kb eksonów.
Warianty z podstroną (66)
Warianty PKP2 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|
| c.1A>G | Ekson 1 | 32 896 731 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.369G>A | Ekson 3 | 32 878 511 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1378+1G>C | Intron 5 | 32 850 765 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1379-2A>T | Intron 5 | 32 841 207 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1379-2047_1379-2043del | Intron 5 | 32 843 247 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1482G>A | Ekson 6 | 32 841 102 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1557-1G>C | Intron 6 | 32 824 163 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1839+2T>A | Intron 8 | 32 822 465 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.2013+1G>A | Intron 9 | 32 821 355 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.2014-1G>C | Intron 9 | 32 802 557 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- CDH2cadherin 2Wspólne schorzenie: 1
- DESdesminWspólne schorzenie: 1
- DSC2desmocollin 2Wspólne schorzenie: 1
- DSG2desmoglein 2Wspólne schorzenie: 1
- DSPdesmoplakinWspólne schorzenie: 1
- JUPjunction plakoglobinWspólne schorzenie: 1
- PLNphospholambanWspólne schorzenie: 1
- RYR2ryanodine receptor 2Wspólne schorzenie: 1
- TMEM43transmembrane protein 43Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem PKP2
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać PKP2. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the cardiovascular system
- Right ventricular cardiomyopathy
- Ventricular tachycardia
- Complete right bundle branch block
- Extra heart beat
- Fainting spell
- Fibrofatty replacement of right ventricular myocardium
- Heart stops beating
- Palpitations
Pokaż jeszcze 13 cech
- Prolonged QRS complex
- ST segment elevation
- Elevated heart rate
- Epsilon wave
- First degree atrioventricular block
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Sick sinus syndrome
- Supraventricular tachycardia
- Ventricular fibrillation
- Sudden cardiac death
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
- Dilatation of the ventricular cavity
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen PKP2: plakophilin 2. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/pkp2
Dante Labs. Gen PKP2: plakophilin 2 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/pkp2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni