Gen
CYP1B1
cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1
- HGNC 2597↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000138061↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 1545↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2p22.2
- Współrzędne
- Chromosom 2: 38 067 509–38 076 151 (GRCh38)
- Eksony
- 3 eksonów na odcinku 8,6 kb
- Białko
- 543 aminokwasów
- Znany również jako
- CP1B
- Poprzednie symbole
- GLC3A
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000610745.5NM_000104.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cyp1b1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj CYP1B1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Jaskra
Wzrost ciśnienia wewnątrzgałkowego spowodowany utrudnionym odpływem cieczy wodnistej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 5 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Krople obniżające ciśnienie wewnątrzgałkowe (analogi prostaglandyn, beta-blokery); selektywna laserowa trabekuloplastyka; zabiegi MIGS; trabekulotomia/goniotomia w jaskrze wrodzonej; kaskadowe badania genetyczne rodziny; coroczne monitorowanie ciśnienia wewnątrzgałkowego u nosicieli
Budowa genu CYP1B1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 5,2 kb z 8,6 kb genu; 1632 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie CYP1B1
6Łatwy
Stopień trudności sekwencjonowania genu CYP1B1 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niemal wszystkie eksony genu CYP1B1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu CYP1B1 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 100%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Waga 60%.0%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 50%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 30%.3,6%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 20%.23%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu CYP1B1 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
110
pozycje w CYP1B1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 8,6 kb genu CYP1B1, łącznie z intronami, a nie tylko 5,2 kb eksonów.
Warianty z podstroną (36)
Warianty CYP1B1 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A106D | c.317C>A | Ekson 2 | 38 075 072 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A179Rfs*18 | c.535del | Ekson 2 | 38 074 853 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A237E | c.710C>A | Ekson 2 | 38 074 679 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A330F | c.988_989delinsTT | Ekson 2 | 38 074 400 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.2T>C | Ekson 2 | 38 075 387 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1044-1G>C | Intron 2 | 38 071 311 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1044-2A>G | Intron 2 | 38 071 312 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| C470Y | c.1409G>A | Ekson 3 | 38 070 945 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| D374N | c.1120G>A | Ekson 3 | 38 071 234 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| E173X | c.517G>T | Ekson 2 | 38 074 872 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
ClinVar pathogenic variants (119)
The CYP1B1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 62
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 1
- Prawdopodobnie patogenny 56
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1568G>C (p.Arg523Thr) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1454C>T (p.Ser485Phe) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1405C>T (p.Arg469Trp) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1331G>A (p.Arg444Gln) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1310C>T (p.Pro437Leu) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1200_1209dup (p.Thr404fs) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1169G>A (p.Arg390His) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1168C>T (p.Arg390Cys) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1168C>A (p.Arg390Ser) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1159G>A (p.Glu387Lys) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1090G>A (p.Val364Met) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1064_1076del (p.Arg355fs) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1063C>T (p.Arg355Ter) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1044-1G>C | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.1044-2A>G | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.868dup (p.Arg290fs) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.797GCAACTTCA[1] (p.Ser269_Phe271del) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.784G>T (p.Glu262Ter) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.535del (p.Ala179fs) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.517G>T (p.Glu173Ter) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.434_443del (p.Arg145fs) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.317C>A (p.Ala106Asp) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.182G>A (p.Gly61Glu) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.171G>A (p.Trp57Ter) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| NM_000104.4(CYP1B1):c.2T>C (p.Met1Thr) | CYP1B1-related glaucoma with or without anterior segment dysgenesis | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
See all 119 with every other CYP1B1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- EFEMP1EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1Wspólne schorzenie: 1
- FOXC1forkhead box C1Wspólne schorzenie: 1
- LTBP2latent transforming growth factor beta binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- MYOCmyocilinWspólne schorzenie: 1
- OPTNoptineurinWspólne schorzenie: 1
- TEKTEK receptor tyrosine kinaseWspólne schorzenie: 1
- THBS1thrombospondin 1Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem CYP1B1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać CYP1B1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the eye
- Peters anomaly
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Central opacification of the cornea
- Glaucoma
- Opacification of the corneal stroma
- Subcapsular cataract
- Thinning of Descemet membrane
- Abnormal anterior chamber morphology
Pokaż jeszcze 34 cech
- Abnormal Descemet membrane morphology
- Abnormality of the iris
- Corneal opacity
- Damaged optic nerve
- Deep anterior chamber
- Developmental glaucoma
- Enlarged cornea
- Enlarged eyeball
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Glaucomatous visual field defect
- High eye pressure
- Increased tears
- Iris degeneration
- Loss of peripheral vision
- Open angle glaucoma
- Optic nerve issue
- Reduced anterior scleral thickness
- Visual impairment
- Anisometropia
- Close sighted
- Decreased clarity of vision
- Increased cup-to-disc ratio
- Iridodonesis
- Lazy eye
- Severe near sightedness
- Temporal optic disc pallor
- Visual loss
- Blind spot located at fixation point
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Late onset congenital glaucoma
- New blood vessel formation in cornea
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Primary congenital glaucoma
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-19: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.19-9814e911.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen CYP1B1: cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/cyp1b1
Dante Labs. Gen CYP1B1: cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/cyp1b1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni