Gen
STXBP1
syntaxin binding protein 1
- HGNC 11444↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000136854↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6812↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 9q34.11
- Koordinater
- Kromosom 9: 127 612 277–127 692 699 (GRCh38)
- Eksoner
- 19 eksoner over 80,4 kb
- Protein
- 594 aminosyrer
- Også kjent som
- hUNC18, MUNC18-1, UNC18, rbSec1, nSec1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000373299.5NM_001032221.6
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stxbp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes STXBP1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Epilepsi (fullstendig panel)
- Epilepsi
Ett av 171 gener knyttet til den
En hjernesykdom preget av episoder med unormalt økt nevronal aktivitet som gir forbigående sanse- eller bevegelsesforstyrrelser eller psykiske forstyrrelser. Disse episodene kan være forbundet med bevissthetstap eller kramper, eller ikke.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er STXBP1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3,8 kb av genets 80,4 kb, og 1 785 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av STXBP1
141
posisjoner i STXBP1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 80,4 kb av STXBP1, inkludert introner, ikke bare de 3,8 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (160)
The STXBP1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 86
- Patogen/sannsynligvis patogen 14
- Sannsynligvis patogen 60
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_001032221.6(STXBP1):c.170-2A>G (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.364C>T (p.Arg122Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.568C>T (p.Arg190Trp) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.578+1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.703C>T (p.Arg235Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.704G>A (p.Arg235Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.842T>C (p.Leu281Pro) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.874C>T (p.Arg292Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.875G>A (p.Arg292His) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1099C>T (p.Arg367Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1108C>T (p.Gln370Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1162C>T (p.Arg388Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1216C>T (p.Arg406Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1359+1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1439C>T (p.Pro480Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1631G>T (p.Gly544Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.1651C>T (p.Arg551Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.37+2dup (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.326-1G>T (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.416C>T (p.Pro139Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.560C>T (p.Pro187Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.569G>A (p.Arg190Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.579-1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.703C>G (p.Arg235Gly) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001032221.6(STXBP1):c.847G>A (p.Glu283Lys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 4 and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
See all 160 with every other STXBP1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme tilstandene
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 1 tilstand
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeler 1 tilstand
- ACTL6Bactin like 6BDeler 1 tilstand
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deler 1 tilstand
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deler 1 tilstand
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeler 1 tilstand
- ARXaristaless related homeoboxDeler 1 tilstand
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deler 1 tilstand
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til STXBP1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene STXBP1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- EEG with burst suppression
- IQ less than 20
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
Vis 37 egenskaper til
- Absent speech development
- Behavioral abnormality
- Delayed CNS myelination
- EEG with focal epileptiform discharges
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cerebellar vermis atrophy
- Cerebral white matter atrophy
- Choreoathetosis
- Dysplastic corpus callosum
- EEG with abnormally slow frequencies
- Epileptic encephalopathy
- Focal impaired awareness seizure
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Multifocal epileptiform discharges
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Delayed myelination
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- Cerebral hypomyelination
- Generalized tonic seizure
- Infantile encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Severe global developmental delay
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-19: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.19-9814e911.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). STXBP1-genet: syntaxin binding protein 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/stxbp1
Dante Labs. STXBP1-genet: syntaxin binding protein 1 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/stxbp1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker