Geen
STXBP1
syntaxin binding protein 1
- HGNC 11444↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000136854↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6812↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 9q34.11
- Koordinaadid
- Kromosoom 9: 127 612 277–127 692 699 (GRCh38)
- Eksonid
- 19 eksonit, ulatus 80,4 kb
- Valk
- 594 aminohapet
- Tuntud ka kui
- hUNC18, MUNC18-1, UNC18, rbSec1, nSec1
- MANE Select transkript
- ENST00000373299.5NM_001032221.6
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe STXBP1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas STXBP1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,8 kb kogupikkusega 80,4 kb; neist 1785 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse STXBP1
141
kohad geenis STXBP1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni STXBP1 80,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,8 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseJagab 1 haigust
- ACTL6Bactin like 6BJagab 1 haigust
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Jagab 1 haigust
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Jagab 1 haigust
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 1 haigust
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Jagab 1 haigust
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Jagab 1 haigust
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorJagab 1 haigust
- ARXaristaless related homeoboxJagab 1 haigust
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Jagab 1 haigust
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Jagab 1 haigust
Geeniga STXBP1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida STXBP1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- EEG with burst suppression
- IQ less than 20
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
Näita veel 37 tunnust
- Absent speech development
- Behavioral abnormality
- Delayed CNS myelination
- EEG with focal epileptiform discharges
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cerebellar vermis atrophy
- Cerebral white matter atrophy
- Choreoathetosis
- Dysplastic corpus callosum
- EEG with abnormally slow frequencies
- Epileptic encephalopathy
- Focal impaired awareness seizure
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Multifocal epileptiform discharges
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Delayed myelination
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- Cerebral hypomyelination
- Generalized tonic seizure
- Infantile encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Severe global developmental delay
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). STXBP1 geen: syntaxin binding protein 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/stxbp1
Dante Labs. STXBP1 geen: syntaxin binding protein 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/stxbp1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast