Gen
ASXL3
ASXL transcriptional regulator 3
- HGNC 29357↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000141431↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 80816↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 18q12.1
- Coördinaten
- Chromosoom 18: 33.578.219–33.751.195 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 173 kb
- Eiwit
- 2.248 aminozuren
- Eerdere symbolen
- KIAA1713
- MANE Select-transcript
- ENST00000269197.12NM_030632.3
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/asxl3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees ASXL3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Intellectuele beperking
Een van 233 genen die hiermee verband houden
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Opbouw van ASXL3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 11,8 kb van de 173 kb van het gen; 6.747 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van ASXL3
2Laag
Hoe moeilijk ASXL3 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van ASXL3 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.6,9%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.4,8%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
134
posities in ASXL3 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 173 kb van ASXL3, inclusief intronen, en niet alleen de 11,8 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deelt 1 aandoening
- ADKadenosine kinaseDeelt 1 aandoening
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeelt 1 aandoening
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deelt 1 aandoening
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deelt 1 aandoening
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ANK3ankyrin 3Deelt 1 aandoening
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deelt 1 aandoening
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deelt 1 aandoening
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deelt 1 aandoening
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deelt 1 aandoening
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan ASXL3
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die ASXL3 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Fullness around the eyes
- Metopic synostosis
- Short columella
- Sloping forehead
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Abnormally small head
Toon 34 kenmerken meer
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- High palate
- High, narrow palate
- Highly arched eyebrow
- Nasal tip, upturned
- Short chin
- Short nose
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide nasal bridge
- Bulbous nose
- Decreased facial expression
- Dental crowding
- Drooping lower lip
- Gum enlargement
- Little lower jaw
- Long eyelashes
- Long nose
- Long, narrow head
- Low hanging columella
- Monobrow
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Open mouth
- Prominent forehead
- Prominent nasal bridge
- Receding chin
- Scaphocephaly
- Thick eyebrow
- Thin eyebrow
- Thin red part of the upper lip
- Triangular head shape
- Wide fontanelles
- Zygomatic flattening
- Broad nasal tip
- Wide mouth
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Lateral ventricle dilatation
- Repetitive movements
- Self-injurious behavior
- Severe global developmental delay
Toon 15 kenmerken meer
- Abnormal speech pattern
- Absent speech development
- Autism spectrum disorder
- Intellectual disability, severe
- IQ less than 20
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Inability to walk
- Inferior cerebellar vermis hypoplasia
- IQ between 34 and 49
- Recurrent hand flapping
- Delayed ability to walk
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). ASXL3-gen: ASXL transcriptional regulator 3. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/asxl3
Dante Labs. ASXL3-gen: ASXL transcriptional regulator 3 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/asxl3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken