Gen
ANXA11
annexin A11
- HGNC 535↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000122359↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 311↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 10q22.3
- Coördinaten
- Chromosoom 10: 80.150.889–80.205.537 (GRCh38)
- Exons
- 16 exons over 54,6 kb
- Eiwit
- 505 aminozuren
- Eerdere symbolen
- ANX11
- MANE Select-transcript
- ENST00000422982.8NM_145868.2
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/anxa11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees ANXA11 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Amyotrofische laterale sclerose (ALS)
- Amyotrofische laterale sclerose
Een neurodegeneratieve aandoening van de bovenste en onderste motorische neuronen, die zowel in sporadische als in familiale vormen voorkomt.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) voor SOD1-ALS; ASO-studies voor C9orf72 en FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (natriumfenylbutyraat-taurursodiol); multidisciplinaire ALS-zorg in een gespecialiseerde kliniek; ademhalingsondersteuning; erfelijkheidsadvies voor familieleden
Bredere groeperingen
Erfelijke neurodegeneratieve aandoeningen
- Met KIF5A samenhangende neurodegeneratieve aandoeningAutosomaal dominant
Een van 372 genen die hiermee verband houden
Veroorzaakt door veranderingen in één kopie van KIF5A, een motoreiwit met een staart die vracht bindt. Verschillende soorten veranderingen leiden tot verschillende aandoeningen: hereditaire spastische paraplegie type 10, een axonale vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth en amyotrofe laterale sclerose (ALS).
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
De zorg is symptomatisch en hangt af van het ziektebeeld; zij omvat fysiotherapie, medicijnen tegen spasticiteit en multidisciplinaire ALS-zorg. Elk kind van een aangedane persoon heeft een kans van 1 op 2 om de verandering te erven; erfelijkheidsadvies helpt gezinnen dit te begrijpen.
Opbouw van ANXA11
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 6,7 kb van de 54,6 kb van het gen; 1.518 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing ANXA11
2Makkelijk
Hoe moeilijk ANXA11 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van ANXA11 liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.
Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van ANXA11 in elk soort moeilijke regio
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, zodat een call daar mogelijk ontbreekt of fout is. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die mogelijk niet volledig worden overspannen. Gewicht 15%.6,7%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die de bibliotheekbereiding dun dekt. Gewicht 10%.9,5%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 10%.0%
Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekendElke balk is het aandeel van de exonbasen van ANXA11 in dat soort moeilijke regio. Elk soort kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra soort voegt steeds minder toe: 0 als geen enkele base in een regio ligt, 100 als elke base op een plek ligt waar reads niet uniek kunnen worden geplaatst.
4
posities in ANXA11 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 54,6 kb van ANXA11, inclusief intronen, en niet alleen de 6,7 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (4)
The ANXA11 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 3
- Waarschijnlijk pathogeen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_145868.2(ANXA11):c.118G>T (p.Asp40Tyr) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 23 and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_145868.2(ANXA11):c.744+1G>A (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 23 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_145868.2(ANXA11):c.119A>G (p.Asp40Gly) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis type 23 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_145868.2(ANXA11):c.112G>A (p.Gly38Arg) (opens in a new tab) | amyotrophic lateral sclerosis and 1 other | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Deelt 2 aandoeningen
- ANGangiogeninDeelt 2 aandoeningen
- C9orf72C9orf72-SMCR8 complex subunitDeelt 2 aandoeningen
- CCNFcyclin FDeelt 2 aandoeningen
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Deelt 2 aandoeningen
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2BDeelt 2 aandoeningen
- CYLDCYLD lysine 63 deubiquitinaseDeelt 2 aandoeningen
- DCTN1dynactin subunit 1Deelt 2 aandoeningen
- ERBB4erb-b2 receptor tyrosine kinase 4Deelt 2 aandoeningen
- FIG4FIG4 phosphoinositide 5-phosphataseDeelt 2 aandoeningen
- FUSFUS RNA binding proteinDeelt 2 aandoeningen
- HNRNPA1heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan ANXA11
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die ANXA11 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abdominal wall muscle weakness
- Generalized muscle weakness
- Lumbago
- Distal muscle wasting
- EMG: positive sharp waves
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatigable weakness of swallowing muscles
Toon 12 kenmerken meer
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle degeneration
- Muscle spasm
- Progressive distal muscular atrophy
- Spastic paraparesis
- Angulated muscle fibers
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Fiber type grouping
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Rimmed vacuoles
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-18: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.18-8b139e39.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). ANXA11-gen: annexin A11. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/anxa11
Dante Labs. ANXA11-gen: annexin A11 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/anxa11
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken