Gen
ANXA11
annexin A11
- HGNC 535↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000122359↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 311↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 10q22.3
- Koordinater
- Kromosom 10: 80 150 889–80 205 537 (GRCh38)
- Eksoner
- 16 eksoner over 54,6 kb
- Protein
- 505 aminosyrer
- Tidligere symboler
- ANX11
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000422982.8NM_145868.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/anxa11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes ANXA11 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Amyotrofisk lateral sklerose (ALS)
- Amyotrofisk lateral sklerose
En nevrodegenerativ lidelse i øvre og nedre motoriske nevroner, som forekommer i sporadiske og familiære former.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) for SOD1-ALS; ASO-studier for C9orf72 og FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (natriumfenylbutyrat-taurursodiol); oppfølging ved multidisiplinær ALS-klinikk; respirasjonsstøtte; genetisk veiledning for familiemedlemmer
Slik er ANXA11 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6,7 kb av genets 54,6 kb, og 1 518 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av ANXA11
2Lav
Hvor vanskelig ANXA11 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av ANXA11s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.6,7 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.9,5 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
4
posisjoner i ANXA11 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 54,6 kb av ANXA11, inkludert introner, og ikke bare de 6,7 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Deler 1 tilstand
- ANGangiogeninDeler 1 tilstand
- C9orf72C9orf72-SMCR8 complex subunitDeler 1 tilstand
- CCNFcyclin FDeler 1 tilstand
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Deler 1 tilstand
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2BDeler 1 tilstand
- CYLDCYLD lysine 63 deubiquitinaseDeler 1 tilstand
- DCTN1dynactin subunit 1Deler 1 tilstand
- ERBB4erb-b2 receptor tyrosine kinase 4Deler 1 tilstand
- FIG4FIG4 phosphoinositide 5-phosphataseDeler 1 tilstand
- FUSFUS RNA binding proteinDeler 1 tilstand
- HNRNPA1heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til ANXA11
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ANXA11 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abdominal wall muscle weakness
- Generalized muscle weakness
- Lumbago
- Distal muscle wasting
- EMG: positive sharp waves
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatigable weakness of swallowing muscles
Vis 12 egenskaper til
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle degeneration
- Muscle spasm
- Progressive distal muscular atrophy
- Spastic paraparesis
- Angulated muscle fibers
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Fiber type grouping
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Rimmed vacuoles
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ANXA11-genet: annexin A11. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/anxa11
Dante Labs. ANXA11-genet: annexin A11 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/anxa11
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker