Genas
ETFA
electron transfer flavoprotein subunit alpha
- HGNC 3481↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000140374↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 2108↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q24.2-q24.3
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 76 215 353–76 311 469 (GRCh38)
- Eksonai
- 12 eksonų per 96,1 kb
- Baltymas
- 333 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- GA2, EMA, MADD
- MANE Select transkriptas
- ENST00000557943.6NM_000126.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/etfa.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite ETFA ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Riebalų oksidacijos ir karnitino ciklo sutrikimai
- Riebalų rūgščių oksidacijos ir ketogenezės sutrikimaiAutosominis recesyvinis
Fermentų ir transporterių defektų grupė, įskaitant MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD ir HADH trūkumą, pirminį karnitino trūkumą bei karnitino-acilkarnitino translokazės trūkumą, kurie badaujant ar sergant gali sukelti mažą cukraus kiekį kraujyje, raumenų irimą, širdies ir kepenų problemas.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Žinodami galite vengti ilgo badavimo, turėti pagalbos planą sergant ir, kai tinka, keisti karnitino vartojimą ar riebalų kiekį maiste, o tai gali užkirsti kelią gyvybei pavojingiems epizodams.
Platesnės grupės
Hipertrofinė kardiomiopatija
- Autosominis dominantinis
Vienas iš 62 su juo susijusių genų
Būklė, kai miokardas hipertrofuojasi be akivaizdžios priežasties. Hipertrofija paprastai būna asimetriška ir gali būti susijusi su kairiojo skilvelio ištakos obstrukcija.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Beta blokatoriai, ne dihidropiridininiai kalcio kanalų blokatoriai, fizinio aktyvumo apribojimas, genetinė konsultacija
Kaip išdėstytas ETFA
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,3 kb iš 96,1 kb geno; 1 002 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: ETFA
1Maža
Kiek sunku sekti ETFA trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo ETFA egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.1,4 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.5,3 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
71
ETFA pozicija, kurioje ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 96,1 kb geno ETFA, įskaitant intronus, o ne tik 2,3 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainTuri 2 bendrų būklių
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaTuri 2 bendrų būklių
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseTuri 2 bendrų būklių
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaTuri 2 bendrų būklių
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Turi 1 bendrą būklę
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainTuri 1 bendrą būklę
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainTuri 1 bendrą būklę
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Turi 1 bendrą būklę
- ALPK3alpha kinase 3Turi 1 bendrą būklę
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseTuri 1 bendrą būklę
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CTuri 1 bendrą būklę
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su ETFA
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti ETFA, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-e609d43e.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). ETFA genas: electron transfer flavoprotein subunit alpha. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/etfa
Dante Labs. ETFA genas: electron transfer flavoprotein subunit alpha [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/etfa
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites