Gén
UBE3A
ubiquitin protein ligase E3A
- HGNC 12496↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000114062↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 7337↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 15q11.2
- Koordináták
- 15. kromoszóma: 25 333 728–25 439 024 (GRCh38)
- Exonok
- 13 exon, összesen 105,3 kb
- Fehérje
- 872 aminosav
- Más néven ismert
- AS, ANCR, E6-AP, FLJ26981
- Korábbi jelölések
- EPVE6AP, HPVE6A
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000648336.2NM_130839.5
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a UBE3A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Angelman Syndrome
A disorder caused by loss of maternal UBE3A function through a 15q11-q13 deletion, paternal uniparental disomy, an imprinting defect or a UBE3A variant.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Seizure, sleep and developmental support; families with a maternally inherited UBE3A variant have a 50% recurrence risk, so genetic counselling is important.
A UBE3A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 105,3 kb-jából 8,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2619 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) UBE3A gént
154
pozíció a(z) UBE3A génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 59 (38%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (8 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (59 hely)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genom a UBE3A gén mind a 105,3 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 8,7 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (15)
Az itt található, oldallal rendelkező UBE3A variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2125-1G>A | 9. intron | 25 354 684 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| E403X | c.1207G>T | 6. exon | 25 370 967 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| F474Yfs*19 | c.1421_1422del | 6. exon | 25 370 751 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G815E | c.2444G>A | 12. exon | 25 340 139 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G870D | c.2609G>A | 13. exon | 25 339 147 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| K856Rfs*4 | c.2567_2570del | 13. exon | 25 339 185 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| L855_K856del | c.2563_2568del | 13. exon | 25 339 187 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| L855F | c.2563C>T | 13. exon | 25 339 193 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| M21T | c.62T>C | 4. exon | 25 405 461 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| N622S | c.1865A>G | 8. exon | 25 356 785 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
A(z) UBE3A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) UBE3A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Ataxia
- Delayed ability to walk
- EEG abnormality
- Global developmental delay
- Happy demeanor
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
Még 43 tulajdonság megjelenítése
- Attention deficit
- Clumsiness
- Delayed speech and language development
- EEG with abnormally slow frequencies
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Neurodevelopmental delay
- Obsessive compulsive behavior
- Sleep-wake cycle disturbance
- Wide based walk
- Abnormal eating behavior
- Abnormal speech pattern
- Apraxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Delayed myelination
- Inappropriate laughter
- Increased appetite
- Intellectual disability, mild
- More active than typical
- Overactive lower leg reflex
- Poor speech
- Short attention span
- Tongue thrusting
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of balance
- Abnormality of movement
- Atypical absence seizure
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brain imaging abnormality
- EEG with focal epileptiform discharges
- Grand mal seizures
- Hyperorality
- Jerking
- Recurrent hand flapping
- Shortened sleep phase
- Tremor
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Increased reflexes
- Limb tremor
- Paroxysmal bursts of laughter
- Progressive gait ataxia
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). UBE3A gén: ubiquitin protein ligase E3A. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ube3a
Dante Labs. UBE3A gén: ubiquitin protein ligase E3A [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ube3a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt