Genas
UBE3A
ubiquitin protein ligase E3A
- HGNC 12496↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000114062↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 7337↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q11.2
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 25 333 728–25 439 024 (GRCh38)
- Eksonai
- 13 eksonų per 105,3 kb
- Baltymas
- 872 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- AS, ANCR, E6-AP, FLJ26981
- Ankstesni simboliai
- EPVE6AP, HPVE6A
- MANE Select transkriptas
- ENST00000648336.2NM_130839.5
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite UBE3A ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Angelmano sindromas
Sutrikimas, kurį sukelia motinos UBE3A funkcijos praradimas dėl 15q11-q13 delecijos, tėvo vienatėvės disomijos, įspaudo (imprinting) defekto ar UBE3A varianto.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Traukulių, miego ir vystymosi palaikymas; šeimose, kuriose motinos paveldėtas UBE3A variantas, pasikartojimo rizika yra 50 %, todėl svarbi genetinė konsultacija.
Kaip išdėstytas UBE3A
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 8,7 kb iš 105,3 kb geno; 2 619 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito UBE3A
154
UBE3A geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 59 (38 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (8 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (59 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 105,3 kb UBE3A geno, įskaitant intronus, o ne tik 8,7 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (15)
Čia pateikiami UBE3A variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2125-1G>A | Intronas 9 | 25 354 684 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| E403X | c.1207G>T | Eksonas 6 | 25 370 967 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| F474Yfs*19 | c.1421_1422del | Eksonas 6 | 25 370 751 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G815E | c.2444G>A | Eksonas 12 | 25 340 139 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G870D | c.2609G>A | Eksonas 13 | 25 339 147 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| K856Rfs*4 | c.2567_2570del | Eksonas 13 | 25 339 185 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L855_K856del | c.2563_2568del | Eksonas 13 | 25 339 187 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L855F | c.2563C>T | Eksonas 13 | 25 339 193 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| M21T | c.62T>C | Eksonas 4 | 25 405 461 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| N622S | c.1865A>G | Eksonas 8 | 25 356 785 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Savybės, susijusios su UBE3A
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti UBE3A, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Ataxia
- Delayed ability to walk
- EEG abnormality
- Global developmental delay
- Happy demeanor
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
Rodyti dar 43 savybių
- Attention deficit
- Clumsiness
- Delayed speech and language development
- EEG with abnormally slow frequencies
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Neurodevelopmental delay
- Obsessive compulsive behavior
- Sleep-wake cycle disturbance
- Wide based walk
- Abnormal eating behavior
- Abnormal speech pattern
- Apraxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Delayed myelination
- Inappropriate laughter
- Increased appetite
- Intellectual disability, mild
- More active than typical
- Overactive lower leg reflex
- Poor speech
- Short attention span
- Tongue thrusting
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of balance
- Abnormality of movement
- Atypical absence seizure
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brain imaging abnormality
- EEG with focal epileptiform discharges
- Grand mal seizures
- Hyperorality
- Jerking
- Recurrent hand flapping
- Shortened sleep phase
- Tremor
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Increased reflexes
- Limb tremor
- Paroxysmal bursts of laughter
- Progressive gait ataxia
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). UBE3A genas: ubiquitin protein ligase E3A. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ube3a
Dante Labs. UBE3A genas: ubiquitin protein ligase E3A [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ube3a
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites