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Gène

VPS33B

VPS33B late endosome and lysosome associated

Résumé

Localisation cytogénétique
15q26.1
Coordonnées
Chromosome 15 : 90 998 673–91 022 594 (GRCh38)
Exons
23 exons sur 23,9 kb
Protéine
617 acides aminés
Aussi appelé
FLJ14848
Transcrit MANE Select
ENST00000333371.8NM_018668.5
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore VPS33B. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de VPS33B

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de VPS33B. VPS33B et 11 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 90 510 634 à 91 510 633.Chromosome 1515q26.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.390,6 Mb90,8 Mb91 Mb91,2 Mb91,4 MbCRTC3 : 90 529 881–90 645 345, brin directCRTC3BLM : 90 717 340–90 816 166, brin directBLMFURIN : 90 868 588–90 883 564, brin directFURINFES : 90 883 695–90 896 371, brin directFESMAN2A2 : 90 902 218–90 922 585, brin directMAN2A2HDDC3 : 90 911 796–90 935 196, brin inverseHDDC3UNC45A : 90 930 180–90 954 093, brin directUNC45ARCCD1 : 90 954 825–90 964 809, brin directRCCD1PRC1 : 90 966 038–90 995 629, brin inversePRC1 : 90 966 190–91 022 566, brin inverseVPS33B : 90 998 673–91 022 594, brin inverseVPS33BSV2B : 91 099 700–91 302 565, brin directSV2BSchéma de VPS33B : 23 exons sur le brin inverse du chromosome 15Exon 22 : 2 sites connus associés à une maladieExon 21 : 2 sites connus associés à une maladieExon 20 : 5 sites connus associés à une maladieExon 18 : 3 sites connus associés à une maladieExon 17 : 3 sites connus associés à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 3 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 2 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 3 sites connus associés à une maladieExon 23 : 90 998 673–90 999 054, 382 basesExon 22 : 90 999 677–90 999 793, 117 basesExon 21 : 90 999 900–90 999 975, 76 basesExon 20 : 91 000 490–91 000 591, 102 basesExon 19 : 91 001 389–91 001 462, 74 basesExon 18 : 91 002 050–91 002 182, 133 basesExon 17 : 91 003 085–91 003 131, 47 basesExon 16 : 91 004 877–91 004 931, 55 basesExon 15 : 91 005 055–91 005 119, 65 basesExon 14 : 91 005 380–91 005 454, 75 basesExon 13 : 91 005 694–91 005 784, 91 basesExon 12 : 91 005 973–91 006 059, 87 basesExon 11 : 91 006 372–91 006 445, 74 basesExon 10 : 91 006 652–91 006 729, 78 basesExon 9 : 91 006 950–91 007 046, 97 basesExon 8 : 91 007 469–91 007 573, 105 basesExon 7 : 91 007 870–91 007 964, 95 basesExon 6 : 91 009 801–91 009 846, 46 basesExon 5 : 91 013 804–91 013 871, 68 basesExon 4 : 91 014 384–91 014 433, 50 basesExon 3 : 91 016 963–91 017 024, 62 basesExon 2 : 91 017 805–91 017 885, 81 basesExon 1 : 91 022 154–91 022 594, 441 bases23201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,5 kb sur les 23,9 kb du gène ; 1 854 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de VPS33B

44

positions de VPS33B où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 23,9 kb de VPS33B, introns compris, et pas seulement les 2,5 kb d'exons.

Traits associés à VPS33B

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que VPS33B peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène VPS33B : VPS33B late endosome and lysosome associated. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vps33b

Vancouver

Dante Labs. Gène VPS33B : VPS33B late endosome and lysosome associated [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vps33b

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