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Gene

VPS33B

VPS33B late endosome and lysosome associated

Sintesi

Localizzazione citogenetica
15q26.1
Coordinate
Cromosoma 15: 90.998.673–91.022.594 (GRCh38)
Esoni
23 esoni su 23,9 kb
Proteina
617 amminoacidi
Noto anche come
FLJ14848
Trascritto MANE Select
ENST00000333371.8NM_018668.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora VPS33B. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di VPS33B

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 15, con una parentesi dove si trova VPS33B. VPS33B e 11 geni nelle vicinanze sul cromosoma 15, da 90.510.634 a 91.510.633.Cromosoma 1515q26.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.390,6 Mb90,8 Mb91 Mb91,2 Mb91,4 MbCRTC3: 90.529.881–90.645.345, filamento direttoCRTC3BLM: 90.717.340–90.816.166, filamento direttoBLMFURIN: 90.868.588–90.883.564, filamento direttoFURINFES: 90.883.695–90.896.371, filamento direttoFESMAN2A2: 90.902.218–90.922.585, filamento direttoMAN2A2HDDC3: 90.911.796–90.935.196, filamento inversoHDDC3UNC45A: 90.930.180–90.954.093, filamento direttoUNC45ARCCD1: 90.954.825–90.964.809, filamento direttoRCCD1PRC1: 90.966.038–90.995.629, filamento inversoPRC1: 90.966.190–91.022.566, filamento inversoVPS33B: 90.998.673–91.022.594, filamento inversoVPS33BSV2B: 91.099.700–91.302.565, filamento direttoSV2BDiagramma di VPS33B: 23 esoni sul filamento inverso del cromosoma 15Esone 22: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 21: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 20: 5 siti noti causativi di malattiaEsone 18: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 17: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 9: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 4: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 1: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 23: 90.998.673–90.999.054, 382 basiEsone 22: 90.999.677–90.999.793, 117 basiEsone 21: 90.999.900–90.999.975, 76 basiEsone 20: 91.000.490–91.000.591, 102 basiEsone 19: 91.001.389–91.001.462, 74 basiEsone 18: 91.002.050–91.002.182, 133 basiEsone 17: 91.003.085–91.003.131, 47 basiEsone 16: 91.004.877–91.004.931, 55 basiEsone 15: 91.005.055–91.005.119, 65 basiEsone 14: 91.005.380–91.005.454, 75 basiEsone 13: 91.005.694–91.005.784, 91 basiEsone 12: 91.005.973–91.006.059, 87 basiEsone 11: 91.006.372–91.006.445, 74 basiEsone 10: 91.006.652–91.006.729, 78 basiEsone 9: 91.006.950–91.007.046, 97 basiEsone 8: 91.007.469–91.007.573, 105 basiEsone 7: 91.007.870–91.007.964, 95 basiEsone 6: 91.009.801–91.009.846, 46 basiEsone 5: 91.013.804–91.013.871, 68 basiEsone 4: 91.014.384–91.014.433, 50 basiEsone 3: 91.016.963–91.017.024, 62 basiEsone 2: 91.017.805–91.017.885, 81 basiEsone 1: 91.022.154–91.022.594, 441 basi23201510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,5 kb dei 23,9 kb del gene; 1854 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge VPS33B

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posizioni in VPS33B in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 23,9 kb di VPS33B, introni inclusi, non solo i 2,5 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene VPS33B: VPS33B late endosome and lysosome associated. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vps33b

Vancouver

Dante Labs. Gene VPS33B: VPS33B late endosome and lysosome associated [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vps33b

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