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Gène

RLIM

ring finger protein, LIM domain interacting

Résumé

Localisation cytogénétique
Xq13.2
Coordonnées
Chromosome X : 74 582 976–74 614 624 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 31,6 kb
Protéine
624 acides aminés
Aussi appelé
NY-REN-43, MGC15161
Symboles précédents
RNF12
Transcrit MANE Select
ENST00000332687.11NM_016120.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de RLIM

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de RLIM. RLIM et 4 gènes à proximité sur le chromosome X, de 74 098 800 à 75 098 799.Chromosome XXq13.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2874,2 Mb74,4 Mb74,6 Mb74,8 Mb75 MbZCCHC13 : 74 304 180–74 305 034, brin directZCCHC13SLC16A2 : 74 421 383–74 534 693, brin directSLC16A2RLIM : 74 582 976–74 614 624, brin inverseRLIMNEXMIF : 74 732 856–74 925 484, brin inverseNEXMIFABCB7 : 75 044 938–75 156 732, brin inverseABCB7Schéma de RLIM : 4 exons sur le brin inverse du chromosome XExon 4 : 5 sites connus associés à une maladieExon 4 : 74 582 976–74 593 061, 10 086 basesExon 3 : 74 594 306–74 594 389, 84 basesExon 2 : 74 595 809–74 596 000, 192 basesExon 1 : 74 614 422–74 614 624, 203 bases43215′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 10,6 kb sur les 31,6 kb du gène ; 1 875 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit RLIM

    5

    positions dans RLIM où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    5 d'entre elles (100 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

    • Segmental duplications (5 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

    Un génome entier couvre les 31,6 kb de RLIM, introns compris, et pas seulement les 10,6 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène RLIM : ring finger protein, LIM domain interacting. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rlim

    Vancouver

    Dante Labs. Gène RLIM : ring finger protein, LIM domain interacting [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rlim

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