Gène
KARS1
lysyl-tRNA synthetase 1
- HGNC 6215↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000065427↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 3735↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 16q23.1
- Coordonnées
- Chromosome 16 : 75 627 724–75 647 665 (GRCh38)
- Exons
- 14 exons sur 19,9 kb
- Protéine
- 597 acides aminés
- Aussi appelé
- KARS2
- Symboles précédents
- DFNB89, KARS
- Transcrit MANE Select
- ENST00000302445.8NM_005548.3
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Perte auditive et surdité
- Surdité génétique non syndromique
L'un des 97 gènes qui lui sont liés
Surdité héréditaire sans autres signes médicaux associés, y compris les formes récessives fréquentes causées par GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC et de nombreux autres gènes, ainsi que les formes dominantes, liées à l'X et mitochondriales.
- 2 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Connaître la cause génétique peut orienter la prise en charge auditive et les décisions concernant l'implant cochléaire, l'éligibilité à des essais de thérapie génique (par exemple pour OTOF) et le conseil génétique familial.
Structure de KARS1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 2 kb sur les 19,9 kb du gène ; 1 794 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit KARS1
19
positions dans KARS1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 19,9 kb de KARS1, introns compris, et pas seulement les 2 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ACTG1actin gamma 1Partage 1 affection
- AFG2BAAA ATPase AFG2BPartage 1 affection
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Partage 1 affection
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11APartage 1 affection
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Partage 1 affection
- CABP2calcium binding protein 2Partage 1 affection
- CD164CD164 moleculePartage 1 affection
- CDC14Acell division cycle 14APartage 1 affection
- CDH23cadherin related 23Partage 1 affection
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentPartage 1 affection
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Partage 1 affection
- CLDN14claudin 14Partage 1 affection
Traits associés à KARS1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que KARS1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal pyramidal sign
- Akinesia
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Delayed ability to walk
- Dystonia
- Elevated brain lactate level by MRS
Afficher 24 traits supplémentaires
- Epilepsy
- Generalized tonic seizure
- Global developmental delay
- Hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Leukodystrophy
- Leukoencephalopathy
- Loss of developmental milestones
- Mental deterioration
- Motor delay
- Peripheral axonal neuropathy
- Self-injurious behavior
- Severe global developmental delay
- Worsening neurological symptoms
- Absent speech development
- Absent brainstem auditory responses
- Diffuse cerebral atrophy
- Gliosis
- Head titubation
- Increased reflexes
- Small cerebellum
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
- Decreased sensation in extremities
- High stepping
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène KARS1 : lysyl-tRNA synthetase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/kars1
Dante Labs. Gène KARS1 : lysyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/kars1
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