Geen
KARS1
lysyl-tRNA synthetase 1
- HGNC 6215↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000065427↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 3735↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 16q23.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 16: 75 627 724–75 647 665 (GRCh38)
- Eksonid
- 14 eksonit, ulatus 19,9 kb
- Valk
- 597 aminohapet
- Tuntud ka kui
- KARS2
- Varasemad tähised
- DFNB89, KARS
- MANE Select transkript
- ENST00000302445.8NM_005548.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe KARS1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kuulmislangus ja kurtus
- Mittesündroomiline pärilik kuulmislangus
Üks 97 sellega seotud geenist
Pärilik kuulmislangus ilma muude meditsiiniliste tunnusteta, sh levinud retsessiivsed vormid, mis on põhjustatud geenidest GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja paljudest teistest geenidest, samuti dominantsed, X-seotud ja mitokondriaalsed vormid.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geneetilise põhjuse teadmine võib aidata otsustada kuulmistoe ja koklea-implantaadi kasutuse üle, hinnata sobivust geeniteraapia uuringutesse (näiteks OTOF) ning toetada perekonna nõustamist.
Kuidas KARS1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2 kb kogupikkusega 19,9 kb; neist 1794 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse KARS1
19
kohad geenis KARS1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni KARS1 19,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ACTG1actin gamma 1Jagab 1 haigust
- AFG2BAAA ATPase AFG2BJagab 1 haigust
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Jagab 1 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 1 haigust
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Jagab 1 haigust
- CABP2calcium binding protein 2Jagab 1 haigust
- CD164CD164 moleculeJagab 1 haigust
- CDC14Acell division cycle 14AJagab 1 haigust
- CDH23cadherin related 23Jagab 1 haigust
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentJagab 1 haigust
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Jagab 1 haigust
- CLDN14claudin 14Jagab 1 haigust
Geeniga KARS1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida KARS1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal pyramidal sign
- Akinesia
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Delayed ability to walk
- Dystonia
- Elevated brain lactate level by MRS
Näita veel 24 tunnust
- Epilepsy
- Generalized tonic seizure
- Global developmental delay
- Hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Leukodystrophy
- Leukoencephalopathy
- Loss of developmental milestones
- Mental deterioration
- Motor delay
- Peripheral axonal neuropathy
- Self-injurious behavior
- Severe global developmental delay
- Worsening neurological symptoms
- Absent speech development
- Absent brainstem auditory responses
- Diffuse cerebral atrophy
- Gliosis
- Head titubation
- Increased reflexes
- Small cerebellum
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
- Decreased sensation in extremities
- High stepping
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). KARS1 geen: lysyl-tRNA synthetase 1. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/kars1
Dante Labs. KARS1 geen: lysyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/kars1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast