Geeni
TK2
thymidine kinase 2
- HGNC 11831↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000166548↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7084↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16q21
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 66 508 003–66 550 122 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 42,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 265 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SCA31
- MANE Select -transkripti
- ENST00000544898.6NM_004614.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tk2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue TK2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Primaarinen mitokondriosairaus
- Mitokondrion DNA:n vähenemän oireyhtymä
Aiheuttajina ovat tumagenomin geenien, kuten POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B ja SUCLA2, variantit. Ne vähentävät mitokondrion DNA:n määrää ja voivat aiheuttaa lihas-, maksa- tai aivosairauden.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tieto on suoraan hyödynnettävissä: POLG-sairaudessa valproaattia on vältettävä, koska se voi aiheuttaa hengenvaarallisen maksavaurion, ja TK2-puutokseen on olemassa nukleosidihoito.
TK2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 42,1 kb:stä; 798 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: TK2
76
TK2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 42,1 kb geenistä TK2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Yhteinen sairaus: 1
- AGKacylglycerol kinaseYhteinen sairaus: 1
- DGUOKdeoxyguanosine kinaseYhteinen sairaus: 1
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 2Yhteinen sairaus: 1
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 4Yhteinen sairaus: 1
- GUK1guanylate kinase 1Yhteinen sairaus: 1
- LIG3DNA ligase 3Yhteinen sairaus: 1
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 1Yhteinen sairaus: 1
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV17Yhteinen sairaus: 1
- MRM2mitochondrial rRNA methyltransferase 2Yhteinen sairaus: 1
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPaseYhteinen sairaus: 1
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
Geeniin TK2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TK2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Difficulty articulating speech
- Peripheral neuropathy
- Pins and needles feeling
- Sensory axonal neuropathy
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal cerebrospinal fluid morphology
- Action tremor
- Ataxia
Näytä 17 piirrettä lisää
- Decreased reflex response
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Depression
- Parkinsonism with favorable response to dopaminergic medication
- Shuffled walk
- Slow movements
- Stooped posture
- Cognitive impairment
- Abnormal basal ganglia morphology
- Delayed motor skills
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Loss of ability to walk in early childhood
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TK2-geeni: thymidine kinase 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tk2
Dante Labs. TK2-geeni: thymidine kinase 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tk2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa