Geeni
TCTN1
tectonic family member 1
- HGNC 26113↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000204852↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 79600↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 12q24.11
- Koordinaatit
- Kromosomi 12: 110 614 129–110 649 430 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 35,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 592 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ21127, TECT1, JBTS13
- MANE Select -transkripti
- ENST00000397659.9NM_001082538.3
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tctn1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue TCTN1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Joubertin oireyhtymä ja siihen liittyvät häiriöt
- Joubertin oireyhtymä
Ciliopatia, jolle on tunnusomaista pikkuaivojen ja aivorungon epämuodostuma (ns. molaarihammasmerkki), lihasjänteyden heikkous, kehityksen viivästyminen ja poikkeavat silmänliikkeet. Joillakin potilailla on myös munuaisten, maksan tai silmien osallisuutta.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
TCTN1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,2 kb geenin 35,3 kb:stä; 1 779 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: TCTN1
45
TCTN1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 35,3 kb geenistä TCTN1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 2,2 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AHI1Abelson helper integration site 1Yhteinen sairaus: 1
- ARL13BARF like GTPase 13BYhteinen sairaus: 1
- ARL3ARF like GTPase 3Yhteinen sairaus: 1
- ARMC9armadillo repeat containing 9Yhteinen sairaus: 1
- B9D1B9 domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- B9D2B9 domain containing 2Yhteinen sairaus: 1
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteinen sairaus: 1
- CEP104centrosomal protein 104Yhteinen sairaus: 1
- CEP120centrosomal protein 120Yhteinen sairaus: 1
- CEP290centrosomal protein 290Yhteinen sairaus: 1
- CEP41centrosomal protein 41Yhteinen sairaus: 1
- CPLANE1ciliogenesis and planar polarity effector complex subunit 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin TCTN1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TCTN1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Oculomotor apraxia
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormally small eyeball
- Absent/small iris
- Clouding of the lens of the eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Hardening of skin and connective tissue
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
Näytä 6 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TCTN1-geeni: tectonic family member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tctn1
Dante Labs. TCTN1-geeni: tectonic family member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tctn1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa