Geeni
SGCG
sarcoglycan gamma
- HGNC 10809↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000102683↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6445↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 13q12.12
- Koordinaatit
- Kromosomi 13: 23 180 979–23 325 162 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 144,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 291 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SCARMD2, DAGA4, SCG3, DMDA, TYPE, A4, MGC130048
- Aiemmat symbolit
- DMDA1, MAM, LGMD2C
- MANE Select -transkripti
- ENST00000218867.4NM_000231.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SGCG ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Dilatoituva kardiomyopatia
Vasemman kammion laajeneminen ja heikentyminen, jota ei selitä sepelvaltimo- tai venttiilisairaus. Perinnölliset muodot liittyvät geeneihin TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN ja moniin muihin geeneihin. Niihin kuuluvat myös Barthin oireyhtymä ja Emery-Dreifussin lihasdystrofiat.
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettisen syyn tunteminen tukee sydämen varhaisempaa seurantaa ja sukulaisten seulontaa. Geeneille, joihin liittyy suuri rytmihäiriöriski, kuten LMNA, FLNC ja RBM20, geneettinen tieto auttaa päättämään rytmin seurannasta ja implantoitavien defibrillaattoreiden käytöstä.
Raajalihasdystrofia (Limb-Girdle)
- Raajavyöhykkeen lihasdystrofia
Raajavyöhykkeen lihasdystrofialla tarkoitetaan useita alatyyppejä, joilla on erilaiset periytymismallit (ja myös diagnoosin varmuus vaihtelee). Taudin kanssa yhteydessä olevia variantteja kantavien kannattaa hakeutua lihas- ja luustoerikoislääkärin arvioon varmistavaa diagnoosia varten.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
SGCG-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,6 kb geenin 144,2 kb:stä; 876 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SGCG
96
SGCG-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 144,2 kb geenistä SGCG, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,6 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (10)
Tässä ovat SGCG-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.195_195+3del | Eksoni 2 | 23 203 888 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.579-2A>G | Introni 6 | 23 320 635 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.703-1G>C | Introni 7 | 23 324 367 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| C283Y | c.848G>A | Eksoni 8 | 23 324 513 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| E176X | c.526G>T | Eksoni 6 | 23 295 435 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| E263K | c.787G>A | Eksoni 8 | 23 324 452 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| F175Lfs*20 | c.525del | Eksoni 6 | 23 295 429 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G30Wfs*30 | c.87dup | Eksoni 2 | 23 203 780 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| L53P | c.158T>C | Eksoni 2 | 23 203 852 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R34P | c.101G>C | Eksoni 2 | 23 203 795 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- FKTNfukutinYhteisiä sairauksia: 2
- LMNAlamin A/CYhteisiä sairauksia: 2
- SGCAsarcoglycan alphaYhteisiä sairauksia: 2
- SGCBsarcoglycan betaYhteisiä sairauksia: 2
- SGCDsarcoglycan deltaYhteisiä sairauksia: 2
- TCAPtitin-capYhteisiä sairauksia: 2
- TTNtitinYhteisiä sairauksia: 2
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Yhteinen sairaus: 1
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Yhteinen sairaus: 1
- ANO5anoctamin 5Yhteinen sairaus: 1
- BAG3BAG cochaperone 3Yhteinen sairaus: 1
- BAG5BAG cochaperone 5Yhteinen sairaus: 1
Geeniin SGCG liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SGCG voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SGCG-geeni: sarcoglycan gamma. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/sgcg
Dante Labs. SGCG-geeni: sarcoglycan gamma [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/sgcg
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa