Γονίδιο
SGCG
sarcoglycan gamma
- HGNC 10809↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000102683↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 6445↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 13q12.12
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 13: 23.180.979–23.325.162 (GRCh38)
- Εξόνια
- 8 έξώνια σε 144,2 kb
- Πρωτεΐνη
- 291 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- SCARMD2, DAGA4, SCG3, DMDA, TYPE, A4, MGC130048
- Προηγούμενα σύμβολα
- DMDA1, MAM, LGMD2C
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000218867.4NM_000231.3
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sgcg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το SGCG, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Διατατική Καρδιομυοπάθεια
Διεύρυνση και αποδυνάμωση της αριστερής κοιλίας που δεν εξηγούνται από νόσο των στεφανιαίων αρτηριών ή των βαλβίδων. Οι κληρονομικές μορφές εμπλέκουν τα γονίδια TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN και πολλά άλλα γονίδια, και περιλαμβάνουν το σύνδρομο Barth και τις μυοπάθειες Emery-Dreifuss.
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η γνώση μιας γενετικής αιτίας στηρίζει την επισταμένη παρακολούθηση της καρδιάς και τον έλεγχο των συγγενών. Για γονίδια με υψηλό κίνδυνο αρρυθμιών, όπως τα LMNA, FLNC και RBM20, βοηθά στη λήψη αποφάσεων σχετικά με την παρακολούθηση του ρυθμού και τους εμφυτεύσιμους απινιδωτές.
Μυοδυστροφία των ζωνών των άκρων
Η μυοδυστροφία των ζωνών των άκρων ορίζεται ως μια ομάδα πολλών υποτύπων με διαφορετικά πρότυπα κληρονομικότητας (ενώ και η διαγνωστική επάρκεια ποικίλλει). Οι φορείς παραλλαγών που σχετίζονται με την πάθηση θα πρέπει να απευθυνθούν σε ειδικό μυοσκελετικών παθήσεων για οριστική διάγνωση.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 6 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Πώς είναι διαταγμένο το SGCG
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
- Παραλλαγές με σελίδα
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 1,6 kb από τα 144,2 kb του γονιδίου· 876 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση SGCG
1Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το SGCG με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του SGCG βρίσκονται σε σημεία όπου οι σύντομες αναγνώσεις αντιστοιχίζονται καθαρά.
Με ό,τι προστίθεται: το ποσοστό των εξονίων του SGCG σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- Δυνατότητα τοποθέτησηςΤμήματα όπου αναγνώσεις 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Βάρος 100%.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογα γονίδια και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Βάρος 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Βάρος 60%.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό τμήμα του συναρμολογημένου γονιδιώματος αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμίζονται οι αναγνώσεις. Βάρος 50%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ίσως δεν τις καλύπτουν πλήρως. Βάρος 30%.0%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 20%.2,5%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες NIST Genome in a Bottle για δύσκολα προς αλληλούχιση περιοχές.Πώς υπολογίζεταιΚάθε μπάρα είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του SGCG που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε μεμονωμένο είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και κάθε επιπλέον είδος προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε κάποιο, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται σε περιοχή όπου οι αναγνώσεις δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
96
θέσεις στο SGCG όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που οι σύντομες αναγνώσεις δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 144,2 kb του SGCG, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 1,6 kb των εξονίων.
Παραλλαγές με σελίδα (10)
Οι παραλλαγές του SGCG με σελίδα εδώ, με τα περισσότερα αστέρια αξιολόγησης πρώτα. Κάθε σελίδα περιγράφει το δημόσιο αρχείο της ClinVar για την παραλλαγή, ποτέ ένα αποτέλεσμα.
| Παραλλαγή | HGVS c. | Εξόνιο ή ιντρόνιο | Θέση (GRCh38) | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|---|---|
| c.195_195+3del | Εξόνιο 2 | 23.203.888 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων | |
| c.579-2A>G | Ιντρόνιο 6 | 23.320.635 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων | |
| c.703-1G>C | Ιντρόνιο 7 | 23.324.367 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων | |
| C283Y | c.848G>A | Εξόνιο 8 | 23.324.513 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| E176X | c.526G>T | Εξόνιο 6 | 23.295.435 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| E263K | c.787G>A | Εξόνιο 8 | 23.324.452 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| F175Lfs*20 | c.525del | Εξόνιο 6 | 23.295.429 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| G30Wfs*30 | c.87dup | Εξόνιο 2 | 23.203.780 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| L53P | c.158T>C | Εξόνιο 2 | 23.203.852 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| R34P | c.101G>C | Εξόνιο 2 | 23.203.795 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
ClinVar pathogenic variants (113)
The SGCG variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 51
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 18
- Πιθανώς παθογόνο 44
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_000231.3(SGCG):c.87dup (p.Gly30fs) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.195+4_195+7del | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.525del (p.Phe175fs) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.526G>T (p.Glu176Ter) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.579-2A>G | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.787G>A (p.Glu263Lys) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.848G>A (p.Cys283Tyr) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.101G>C (p.Arg34Pro) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.158T>C (p.Leu53Pro) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.703-1G>C | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| NM_000231.3(SGCG):c.128T>A (p.Leu43Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.167G>A (p.Trp56Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.177dup (p.Val60fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.195+1G>C (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy and 1 other | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.298-1G>A (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.452_458del (p.Leu150_Phe151insTer) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.496C>T (p.Arg166Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.549dup (p.Val184fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.582dup (p.Glu195fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.92G>A (p.Trp31Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.205G>C (p.Gly69Arg) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.216T>A (p.Cys72Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.230dup (p.Leu78fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.260T>G (p.Leu87Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_000231.3(SGCG):c.298-2A>G (opens in a new tab) | autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2C | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
See all 113 with every other SGCG variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- FKTNfukutinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- LMNAlamin A/CΜοιράζεται 2 παθήσεις
- SGCAsarcoglycan alphaΜοιράζεται 2 παθήσεις
- SGCBsarcoglycan betaΜοιράζεται 2 παθήσεις
- SGCDsarcoglycan deltaΜοιράζεται 2 παθήσεις
- TCAPtitin-capΜοιράζεται 2 παθήσεις
- TTNtitinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Μοιράζεται 1 πάθηση
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- ANO5anoctamin 5Μοιράζεται 1 πάθηση
- BAG3BAG cochaperone 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- BAG5BAG cochaperone 5Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το SGCG
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το SGCG. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο SGCG: sarcoglycan gamma. Ανάκτηση 19 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/sgcg
Dante Labs. Γονίδιο SGCG: sarcoglycan gamma [Internet]. [ανακτήθηκε 19 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/sgcg
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες