Gene
TRIM28
tripartite motif containing 28
- HGNC 16384↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000130726↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 10155↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 19q13.43
- Coordinate
- Cromosoma 19: 58.544.064–58.550.715 (GRCh38)
- Esoni
- 17 esoni su 6,7 kb
- Proteina
- 835 amminoacidi
- Noto anche come
- TIF1B, KAP1, TF1B, RNF96, PPP1R157, KAP-1, TIF1-beta, TIF1beta
- Trascritto MANE Select
- ENST00000253024.10NM_005762.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Tumore del rene
Neoplasia maligna primitiva o metastatica che interessa il rene.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Tumore dell'apparato urinario e renale
- Neoplasia dell'apparato urinario
Una neoplasia benigna o maligna, primitiva o metastatica, che interessa l'apparato urinario.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Struttura di TRIM28
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,4 kb dei 6,7 kb del gene; 2508 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge TRIM28
4
posizioni in TRIM28 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 6,7 kb di TRIM28, introni inclusi, non solo i 3,4 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Condivide 2 condizioni
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Condivide 2 condizioni
- FLCNfolliculinCondivide 2 condizioni
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseCondivide 2 condizioni
- PAX6paired box 6Condivide 2 condizioni
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BCondivide 2 condizioni
- TP53tumor protein p53Condivide 2 condizioni
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorCondivide 2 condizioni
- RETret proto-oncogeneCondivide 1 condizione
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ACondivide 1 condizione
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Condivide 1 condizione
Tratti collegati a TRIM28
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che TRIM28 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene TRIM28: tripartite motif containing 28. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/trim28
Dante Labs. Gene TRIM28: tripartite motif containing 28 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/trim28
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