Gen
TRIM28
tripartite motif containing 28
- HGNC 16384↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000130726↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 10155↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 19q13.43
- Koordinater
- Kromosom 19: 58 544 064–58 550 715 (GRCh38)
- Exoner
- 17 exoner på 6,7 kb
- Protein
- 835 aminosyror
- Även känd som
- TIF1B, KAP1, TF1B, RNF96, PPP1R157, KAP-1, TIF1-beta, TIF1beta
- MANE Select-transkript
- ENST00000253024.10NM_005762.3
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/trim28.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs TRIM28, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Njurcancer
Primär eller metastaserande malign neoplasm som involverar njuren.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Tumör i urinvägar och njurar
- Neoplasm i urinvägarna
En godartad eller elakartad, primär eller metastaserande neoplasm som omfattar urinvägarna.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är TRIM28 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,4 kb av genens 6,7 kb, och 2 508 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av TRIM28
4
positioner i TRIM28 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 6,7 kb av TRIM28, inklusive introner, och inte bara de 3,4 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Delar 2 tillstånd
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Delar 2 tillstånd
- FLCNfolliculinDelar 2 tillstånd
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseDelar 2 tillstånd
- PAX6paired box 6Delar 2 tillstånd
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BDelar 2 tillstånd
- TP53tumor protein p53Delar 2 tillstånd
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorDelar 2 tillstånd
- RETret proto-oncogeneDelar 1 tillstånd
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ADelar 1 tillstånd
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till TRIM28
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TRIM28 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TRIM28-genen: tripartite motif containing 28. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/trim28
Dante Labs. TRIM28-genen: tripartite motif containing 28 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/trim28
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor