Geen
MLH1
mutL homolog 1
- HGNC 7127↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000076242↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 4292↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3p22.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 36 993 518–37 050 846 (GRCh38)
- Eksonid
- 19 eksonit, ulatus 57,3 kb
- Valk
- 756 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- HNPCC, FCC2, HNPCC2, MLH-1
- Varasemad tähised
- COCA2
- MANE Select transkript
- ENST00000231790.8NM_000249.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe MLH1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Lynch-sündroom
- Muir-Torre sündroomAutosoomne dominantne
Lynchi sündroomi vorm, mis on tavaliselt põhjustatud MSH2 või MLH1 variantidest ja mille korral tekivad talunäärmete kasvajad või keratoakantoomid koos siseorganite vähiga.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Lynchi sündroomi jälgimine ning regulaarne nahakontroll.
- Autosoomne dominantne
Pärilik mittepolüpoosne jämesoolevähi sündroom, mis tuleneb idurada DNA parandusdefektidest, millega kaasneb varajane jämesoole-, emaka- ja muude vähkide teke.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Täiendatud kolonoskoopiline jälgimine, aspiriiniga kemoprevendi, immuunkontrollpunkti inhibiitorid MSI-kõrgete kasvajate korral, kaskaadne testimine ja riski vähendav günekoloogiline operatsioon
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas MLH1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 57,3 kb; neist 2271 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse MLH1
1126
kohad geenis MLH1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 1 (0,1%) asub lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (1 koht)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni MLH1 57,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,5 kb).
Variandid, millel on leht (616)
Siin on MLH1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A21E | c.62C>A | Ekson 1 | 36 993 609 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A21Rfs*15 | c.61del | Ekson 1 | 36 993 606 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A21V | c.62C>T | Ekson 1 | 36 993 609 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A29G | c.86C>G | Ekson 1 | 36 993 633 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A29Lfs*7 | c.84del | Ekson 1 | 36 993 630 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A111V | c.332C>T | Ekson 4 | 37 004 426 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A125Ifs*15 | c.372_373del | Ekson 4 | 37 004 462 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A128P | c.382G>C | Ekson 5 | 37 006 992 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A128Qfs*8 | c.382del | Ekson 5 | 37 006 991 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A128Sfs*6 | c.382_402delinsT | Ekson 5 | 37 006 992 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- MSH2mutS homolog 2Jagab 3 haigust
- MSH6mutS homolog 6Jagab 2 haigust
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentJagab 2 haigust
- APTXaprataxinJagab 1 haigust
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Jagab 1 haigust
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Jagab 1 haigust
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CJagab 1 haigust
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Jagab 1 haigust
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeJagab 1 haigust
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitJagab 1 haigust
Geeniga MLH1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida MLH1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Astrocytoma
- Glioblastoma multiforme
- Agenesis of corpus callosum
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
Näita veel 22 tunnust
- Gray matter heterotopia
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Oligodendroglioma
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Pleomorphic xanthoastrocytoma
- Ependymoma
- Medulloblastoma
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Constipation
- Malabsorption
- Adenomatous colonic polyposis
- Colon cancer
- Nausea and vomiting
- Rectal tumor
- Stomach tumor
Näita veel 11 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). MLH1 geen: mutL homolog 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/mlh1
Dante Labs. MLH1 geen: mutL homolog 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/mlh1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast