Gen
SPI1
Spi-1 proto-oncogene
- HGNC 11241↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000066336↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6688↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11p11.2
- Koordinater
- Kromosom 11: 47 354 860–47 378 547 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner på 23,7 kb
- Protein
- 270 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- PU.1, SPI-A, OF, SFPI1, SPI-1
- MANE Select-transkript
- ENST00000378538.8NM_003120.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SPI1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Agammaglobulinämi (XLA och autosomala former)
- Agammaglobulinemi 10 (SPI1)Autosomalt dominant
Antikroppsbrist med minskat antal B-celler orsakad av en förändrad kopia av SPI1 (PU.1).
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Livslång ersättningsbehandling med immunglobuliner, snabb behandling av infektioner och att undvika levande vacciner förebygger de flesta allvarliga komplikationer.
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Medfödd immunbrist
En av 114 gener kopplade till den
Ärftliga sjukdomar i immunsystemet orsakade av förändringar i enskilda gener, som påverkar hur kroppen bekämpar infektioner eller reglerar inflammation.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är SPI1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,4 kb av genens 23,7 kb, och 813 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SPI1
7
positioner i SPI1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 23,7 kb av SPI1, med introner inräknade, inte bara de 1,4 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 2 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 2 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 2 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 2 tillstånd
- BLNKB cell linkerDelar 2 tillstånd
- BTKBruton tyrosine kinaseDelar 2 tillstånd
- C1QAcomplement C1q A chainDelar 2 tillstånd
- C1QBcomplement C1q B chainDelar 2 tillstånd
- C1QCcomplement C1q C chainDelar 2 tillstånd
- C1Scomplement C1sDelar 2 tillstånd
- C2complement C2Delar 2 tillstånd
- C3complement C3Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till SPI1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SPI1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SPI1-genen: Spi-1 proto-oncogene. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/spi1
Dante Labs. SPI1-genen: Spi-1 proto-oncogene [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/spi1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor