Gen
SCARB2
scavenger receptor class B member 2
- HGNC 1665↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000138760↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 950↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 4q21.1
- Koordinater
- Kromosom 4: 76 158 737–76 213 824 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 55,1 kb
- Protein
- 478 aminosyror
- Även känd som
- HLGP85, LIMPII, SR-BII, LIMP-2
- Tidigare symboler
- CD36L2
- MANE Select-transkript
- ENST00000264896.8NM_005506.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scarb2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SCARB2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SCARB2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,7 kb av genens 55,1 kb, och 1 437 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SCARB2
30
positioner i SCARB2 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 55,1 kb av SCARB2, inklusive introner, och inte bara de 4,7 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDelar 1 tillstånd
- ACTL6Bactin like 6BDelar 1 tillstånd
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Delar 1 tillstånd
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Delar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDelar 1 tillstånd
- ARXaristaless related homeoboxDelar 1 tillstånd
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Delar 1 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SCARB2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SCARB2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Normochromic anemia
- Abnormality of coagulation
- Bleeding gums
- Bruising susceptibility
- Low blood cell count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Bleeding tendency
Visa ytterligare 2 egenskaper
Laboratory abnormality
- Fluid retention
- High urine protein levels
- Low albumin
- Decreased beta-glucocerebrosidase level
- Anasarca
- Elevated serum ferritin
- Fluid around lungs
- Blood in urine
Visa ytterligare 2 egenskaper
Abnormality of the digestive system
- Anorexia
- Enlarged liver
- Abdominal pain
- Poor swallowing
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Biliary tract obstruction
- Gallstones
- Liver failure
Visa ytterligare 1 egenskap
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bone pain
- Breakdown of bone
- Death of bone due to decreased blood supply
- Delayed bone maturation
- Osteopenia
- Osteoporosis
- Compression fracture of a vertebral body
- Degenerative joint disease
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SCARB2-genen: scavenger receptor class B member 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/scarb2
Dante Labs. SCARB2-genen: scavenger receptor class B member 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/scarb2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor