Genă
TNFRSF11B
TNF receptor superfamily member 11b
- HGNC 11909↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000164761↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 4982↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 8q24.12
- Coordonate
- Cromozomul 8: 118.923.557–118.951.885 (GRCh38)
- Exoni
- 5 de exoni pe 28,3 kb
- Proteină
- 401 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- OCIF, TR1
- Simboluri anterioare
- OPG
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000297350.9NM_002546.4
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tnfrsf11b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți TNFRSF11B și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Boala Paget osoasă familială
- Boala Paget juvenilăAutozomal recesivă
O tulburare osoasă rară cu debut în copilărie, cauzată de variante ale genei TNFRSF11B, cu remodelare osoasă rapidă, durere osoasă, fracturi și deformare.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Structura genei TNFRSF11B
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 2,1 kb din cei 28,3 kb ai genei; 1.206 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea TNFRSF11B
3Scăzut
Cât de greu este de secvențiat TNFRSF11B cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale TNFRSF11B aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.1,9 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.28 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
3
poziții în TNFRSF11B unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un genom întreg acoperă toți cei 28,3 kb ai lui TNFRSF11B, inclusiv intronii, nu doar cei 2,1 kb de exoni.
Trăsături asociate cu TNFRSF11B
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca TNFRSF11B. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Laboratory abnormality
- Elevated alkaline phosphatase
- Elevated urine calcium levels
- Increased urine deoxypyridinoline level
- High blood uric acid level
- Joint swelling
- Fever
- Elevated urinary hydroxyproline
- High blood hydroxyproline levels
Afișați încă 1 trăsătură
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-17: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena TNFRSF11B: TNF receptor superfamily member 11b. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/tnfrsf11b
Dante Labs. Gena TNFRSF11B: TNF receptor superfamily member 11b [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/tnfrsf11b
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni