Gen
RPS6KA3
ribosomal protein S6 kinase A3
- HGNC 10432↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000177189↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6197↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- Xp22.12
- Koordinater
- Kromosom X: 20 149 911–20 266 909 (GRCh38)
- Eksoner
- 22 eksoner over 117 kb
- Protein
- 740 aminosyrer
- Også kjent som
- RSK2, HU-3
- Tidligere symboler
- MRX19, CLS
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000379565.9NM_004586.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rps6ka3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes RPS6KA3 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Intellektuell funksjonsnedsettelse
Ett av 233 gener knyttet til den
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er RPS6KA3 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 8 kb av genets 117 kb, og 2 223 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av RPS6KA3
2Lav
Hvor vanskelig RPS6KA3 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av RPS6KA3s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0,5 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.4,9 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.9,4 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
83
posisjoner i RPS6KA3 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 117 kb av RPS6KA3, inkludert introner, og ikke bare de 8 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 tilstand
- ADKadenosine kinaseDeler 1 tilstand
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 tilstand
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 tilstand
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 tilstand
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 tilstand
- ANK3ankyrin 3Deler 1 tilstand
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 tilstand
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 tilstand
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til RPS6KA3
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene RPS6KA3 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of head or neck
- Broad columella
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full lower lip
- Prominent forehead
- Short nose
- Thick nasal alae
- Thick nasal septum
- Abnormality of dental shape
Vis 33 egenskaper til
- Coarse facial features
- Depressed nasal bridge
- Drooping lower lip
- Enlargement of craniofacial bones
- Eye folds
- Failure of development of between one and six teeth
- Frontal bossing
- Nasal tip, upturned
- Open mouth
- Widely spaced teeth
- Abnormally small head
- Broad nasal tip
- Cone shaped front tooth
- Decreased size of maxilla
- Early tooth loss
- High palate
- Narrow palate
- Wide mouth
- Wide nose
- Deep central lingual groove
- Delayed eruption of teeth
- Dental crowding
- Early eruption of teeth
- Failure of development of all teeth
- Failure of development of more than six teeth
- Bad bite
- Big lower jaw
- Corners of eye widely separated
- Delayed closure of the soft spot on the skull
- Highly arched eyebrow
- Increased thickness of skull cap
- Prominent brow
- Thick eyebrow
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Ventriculomegaly
- Abnormal speech pattern
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Delayed speech and language development
Vis 13 egenskaper til
- Abnormality of neuronal migration
- Absent/small cerebellum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Behavioral abnormality
- Bipolar disorder
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Depression
- Epilepsy
- Motor delay
- Pauses in breathing while sleeping
- Psychosis
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
Abnormality of the cardiovascular system
- Short chordae tendineae of the mitral valve
- Short chordae tendineae of the tricuspid valve
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal mitral valve morphology
- Abnormal tricuspid valve morphology
- Disease of the heart muscle
- Cutis marmorata
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RPS6KA3-genet: ribosomal protein S6 kinase A3. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rps6ka3
Dante Labs. RPS6KA3-genet: ribosomal protein S6 kinase A3 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rps6ka3
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker