Gen
PTPN2
protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2
- HGNC 9650↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000175354↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 5771↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 18p11.21
- Coördinaten
- Chromosoom 18: 12.792.152–12.884.237 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons over 92,1 kb
- Eiwit
- 415 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- TCELLPTP, TC-PTP, TCPTP, TC45, TC48
- Eerdere symbolen
- PTPT
- MANE Select-transcript
- ENST00000309660.10NM_002828.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees PTPN2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Zeldzame monogene auto-inflammatoire ziekten
- Auto-inflammatie en auto-immuniteit gerelateerd aan PTPN2Autosomaal dominant
Vroeg begonnen inflammatoire en auto-immuunziekte, waaronder colitis en artritis, veroorzaakt door varianten in PTPN2.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van PTPN2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,5 kb van de 92,1 kb van het gen; 1.248 van die basen coderen voor het eiwit.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACP5acid phosphatase 5, tartrate resistantDeelt 1 aandoening
- ADA2adenosine deaminase 2Deelt 1 aandoening
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeelt 1 aandoening
- COPAcoat protein complex I subunit alphaDeelt 1 aandoening
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deelt 1 aandoening
- POLA1DNA polymerase alpha 1, catalytic subunitDeelt 1 aandoening
- POMPproteasome maturation proteinDeelt 1 aandoening
- PSMB10proteasome 20S subunit beta 10Deelt 1 aandoening
- PSMB8proteasome 20S subunit beta 8Deelt 1 aandoening
- PSMB9proteasome 20S subunit beta 9Deelt 1 aandoening
- RIGIRNA sensor RIG-IDeelt 1 aandoening
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan PTPN2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PTPN2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PTPN2-gen: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/ptpn2
Dante Labs. PTPN2-gen: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/ptpn2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken