Genas
SPR
sepiapterin reductase
- HGNC 11257↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000116096↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6697↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 2p13.2
- Koordinatės
- Chromosoma 2: 72 887 408–72 892 158 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 4,8 kb
- Baltymas
- 261 aminorūgštis
- Taip pat žinomas kaip
- SDR38C1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000234454.6NM_003124.5
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/spr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SPR ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
BH4 nepakankamumas ir monoamininių neuroperdavikliųsutrikimai
- Sepiapterino reduktazės nepakankamumasAutosominis recesyvinis
Sukelia SPR variantai, kurie sumažina dopamino ir serotonino kiekį ir sukelia judesio problemas, svyruojantį silpnumą ir vystymosi vėlavimą, be padidėjusio fenilalanino kiekio.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Žinojimas leidžia taikyti gydymą L-dopa ir 5-hidroksitriptofanu, o tai gali žymiai pagerinti simptomus.
- Hiperfenilalaninemija dėl BH4 nepakankamumoAutosominis recesyvinis
Sukelia PTS, QDPR, PCBD1 arba GCH1 variantai, kurie padidina fenilalanino kiekį ir sumažina dopamino bei serotonino kiekį, todėl atsiranda judesio sutrikimų, traukulių ir vystymosi vėlavimas.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Žinojimas leidžia taikyti gydymą BH4, neuroperdavikliųpirmtakais (L-dopa, 5-hidroksitriptofanu) ir prireikus folinine rūgštimi.
Distonija, miotonija, paroksizminė diskinezija
- Paveldima distonija
Bendras terminas, apimantis paveldimas distonijas, įskaitant DYT-TOR1A ankstyvos pradžios generalizuotą distoniją, DYT-THAP1, mioklonijos-distonijos (SGCE) ir su KMT2B susijusią distoniją.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas SPR
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,4 kb iš 4,8 kb geno; 786 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: SPR
2Maža
Kiek sunku sekti SPR trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo SPR egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.0 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.23 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
26
SPR pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 4,8 kb geno SPR, įskaitant intronus, o ne tik 1,4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- GCH1GTP cyclohydrolase 1Turi 2 bendrų būklių
- ACTBactin betaTuri 1 bendrą būklę
- ANO3anoctamin 3Turi 1 bendrą būklę
- ARFGEF3ARFGEF family member 3Turi 1 bendrą būklę
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Turi 1 bendrą būklę
- BCAP31B cell receptor associated protein 31Turi 1 bendrą būklę
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainTuri 1 bendrą būklę
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 17Turi 1 bendrą būklę
- GNALG protein subunit alpha LTuri 1 bendrą būklę
- HPCAhippocalcinTuri 1 bendrą būklę
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Turi 1 bendrą būklę
- KCTD17potassium channel tetramerization domain containing 17Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SPR
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SPR, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SPR genas: sepiapterin reductase. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/spr
Dante Labs. SPR genas: sepiapterin reductase [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/spr
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites