Gen
SPR
sepiapterin reductase
- HGNC 11257↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000116096↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6697↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2p13.2
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 72.887.408–72.892.158 (GRCh38)
- Exons
- 3 exons over 4,8 kb
- Eiwit
- 261 aminozuren
- Ook bekend als
- SDR38C1
- MANE Select-transcript
- ENST00000234454.6NM_003124.5
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/spr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SPR en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
BH4-deficiëntie en monoamine-neurotransmitterstoornissen
- Sepiapterinereductase-deficiëntieAutosomaal recessief
Veroorzaakt door varianten in SPR, die dopamine en serotonine verlagen en bewegingsproblemen, wisselende zwakte en ontwikkelingsvertraging veroorzaken, zonder verhoogd fenylalanine.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u dit weet, kan er behandeld worden met L-dopa en 5-hydroxytryptofaan, wat de symptomen aanzienlijk kan verbeteren.
- Hyperfenylalaninemie door BH4-deficiëntieAutosomaal recessief
Veroorzaakt door varianten in PTS, QDPR, PCBD1 of GCH1, die fenylalanine doen stijgen en dopamine en serotonine verlagen, wat leidt tot bewegingsproblemen, epileptische aanvallen en ontwikkelingsvertraging.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u dit weet, kan er behandeld worden met BH4, neurotransmitterprecursoren (L-dopa, 5-hydroxytryptofaan) en indien nodig foliumzuur (folinezuur).
Dystonie, Myotonie, Paroxysmale Dyskinesie
- Erfelijke dystonie
Overkoepelende term voor erfelijke dystonieën, waaronder early-onset gegeneraliseerde dystonie door DYT-TOR1A, DYT-THAP1, myoclonus-dystonie (SGCE) en KMT2B-gerelateerde dystonie.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van SPR
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,4 kb van de 4,8 kb van het gen; 786 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SPR
2Laag
Hoe moeilijk SPR met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van SPR in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.0%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.23%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
26
posities in SPR waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 4,8 kb van SPR, inclusief intronen, en niet alleen de 1,4 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- GCH1GTP cyclohydrolase 1Deelt 2 aandoeningen
- ACTBactin betaDeelt 1 aandoening
- ANO3anoctamin 3Deelt 1 aandoening
- ARFGEF3ARFGEF family member 3Deelt 1 aandoening
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deelt 1 aandoening
- BCAP31B cell receptor associated protein 31Deelt 1 aandoening
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeelt 1 aandoening
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 17Deelt 1 aandoening
- GNALG protein subunit alpha LDeelt 1 aandoening
- HPCAhippocalcinDeelt 1 aandoening
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Deelt 1 aandoening
- KCTD17potassium channel tetramerization domain containing 17Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SPR
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SPR kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.18-e609d43e.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SPR-gen: sepiapterin reductase. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/spr
Dante Labs. SPR-gen: sepiapterin reductase [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/spr
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken