Genas
SDHC
succinate dehydrogenase complex subunit C
- HGNC 10682↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000143252↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6391↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1q23.3
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 161 314 381–161 363 206 (GRCh38)
- Eksonai
- 6 eksonų per 48,8 kb
- Baltymas
- 169 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Taip pat žinomas kaip
- CYB560, cybL
- Ankstesni simboliai
- PGL3
- MANE Select transkriptas
- ENST00000367975.7NM_003001.5
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Perskaitykite SDHC ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Paveldima feochromocitoma ir paragangliomos
- Carney–Stratakis sindromasAutosominis dominantinis
Paragangliomos ir virškinimo trakto stromos navikų derinys, sukeltas SDH genų variantų.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Stebėsena apima tiek paragangliomas, tiek virškinimo trakto stromos navikus.
- Paveldima feochromocitoma–paragangliomosAutosominis dominantinis
Sindromų grupė (PPGL 1–7 tipai, susiję su TMEM127 ir MAX), kurioje SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX arba TMEM127 variantai padidina feochromocitomos ir paragangliomos riziką.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Ką duoda žinojimas
Reguliarus metanefrinų tyrimas kraujyje ar šlapime ir periodinis viso kūno MRT padeda aptikti navikus anksti, dar prieš jiems sukeliant kraujospūdžio krizes; giminaičiams gali būti siūlomas tyrimas.
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas SDHC
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,3 kb iš 48,8 kb geno; 510 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito SDHC
84
SDHC geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 16 (19 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (16 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 48,8 kb SDHC geno, įskaitant intronus, o ne tik 1,3 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (28)
Čia pateikiami SDHC variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|
| c.1A>G | Eksonas 1 | 161 314 406 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.1A>T | Eksonas 1 | 161 314 406 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.2T>G | Eksonas 1 | 161 314 407 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.3G>A958G-A | Eksonas 1 | 161 314 408 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.21-2A>G | Intronas 1 | 161 323 612 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.179+1G>C | Intronas 3 | 161 328 498 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.180-2A>G | Intronas 3 | 161 340 592 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.242-2_242-1insG | Intronas 4 | 161 356 675 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.386G>A | Eksonas 5 | 161 356 821 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.405+1G>C | Intronas 5 | 161 356 841 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BTuri 2 bendrų būklių
- SDHDsuccinate dehydrogenase complex subunit DTuri 2 bendrų būklių
- MAXMYC associated transcriptional regulator XTuri 1 bendrą būklę
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ATuri 1 bendrą būklę
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Turi 1 bendrą būklę
- TMEM127transmembrane protein 127Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SDHC
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SDHC, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the endocrine system
- Paraganglioma
- Adrenal pheochromocytoma
- Extraadrenal pheochromocytoma
- Pheochromocytoma
- Adrenal overactivity
- Adrenocortical adenoma
- Paraganglioma of head and neck
- Chemodectoma
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SDHC genas: succinate dehydrogenase complex subunit C. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/sdhc
Dante Labs. SDHC genas: succinate dehydrogenase complex subunit C [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/sdhc
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites