Gene
TPP1
tripeptidyl peptidase 1
- HGNC 2073↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000166340↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 1200↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 11p15.4
- Coordinate
- Cromosoma 11: 6.612.768–6.619.422 (GRCh38)
- Esoni
- 13 esoni su 6,7 kb
- Proteina
- 563 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- LPIC, TPP-1
- Simboli precedenti
- CLN2, SCAR7
- Trascritto MANE Select
- ENST00000299427.12NM_000391.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Lipofuscinosi ceroide neuronale
- Autosomica recessiva
Un gruppo di patologie cerebrali degenerative progressive ed ereditarie, caratterizzate clinicamente da declino delle capacità cognitive e di altre funzioni, epilessia e perdita della vista dovuta a degenerazione retinica, e istopatologicamente dall'accumulo intracellulare di un materiale autofluorescente, la lipofuscina ceroide, nei neuroni cerebrali e retinici.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 7 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Atassie cerebellari autosomiche recessive (incluse CANVAS e AVED)
- Atassia cerebellare autosomica recessivaAutosomica recessiva
Uno di 57 geni collegati ad esso
Un gruppo di atassie a trasmissione recessiva causate da varianti bialleliche in geni come RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 e SYNE1.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
L'atassia con deficit di vitamina E (TTPA) è trattabile con integratori di vitamina E; le altre forme sono gestite con fisioterapia e cure sintomatiche, e ai familiari può essere proposto il test di portatore.
Malattia da accumulo lisosomiale
- Malattia da accumulo lisosomiale (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 59 geni collegati ad esso
Copre le malattie da accumulo lisosomiale senza un referto dedicato, come la malattia di Farber e altre patologie correlate ad ASAH1, le deficienze di prosaposina (PSAP), la deficienza multipla di solfatasi, le mucopolisaccaridosi di tipo IX e X e la malattia di Dorfman-Chanarin; l'ereditarietà varia a seconda del sottotipo, più spesso autosomica recessiva.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 7 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di TPP1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,5 kb dei 6,7 kb del gene; 1692 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge TPP1
146
posizioni in TPP1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 6,7 kb di TPP1, introni inclusi, non solo i 3,5 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Condivide 2 condizioni
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninCondivide 2 condizioni
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseCondivide 2 condizioni
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinCondivide 2 condizioni
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinCondivide 2 condizioni
- CTSDcathepsin DCondivide 2 condizioni
- CTSFcathepsin FCondivide 2 condizioni
- CYP27A1cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1Condivide 2 condizioni
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Condivide 2 condizioni
- GRNgranulin precursorCondivide 2 condizioni
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Condivide 2 condizioni
- MFSD8major facilitator superfamily domain containing 8Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a TPP1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che TPP1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Degeneration of cerebellum
- Explosive speech
- Lack of coordination of movement
- Truncal titubation
- Unsteady walk
- Postural tremor
- Progressive cerebellar ataxia
Mostra altri 18 tratti
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Clumsiness
- Difficulty articulating speech
- Impaired vibratory sensation
- Increased reflexes
- Limb ataxia
- Progressive gait ataxia
- Wide based walk
- Inability to coordinate movements when walking
- Abnormal nervous system electrophysiology
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Increased extraneuronal autofluorescent lipopigment
- Increased neuronal autofluorescent lipopigment
- Jerking
- Loss of developmental milestones
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Oculomotor apraxia
- Double vision
- Horizontal nystagmus
- Saccadic smooth pursuit interruptions
- Uncoordinated eye movement
- Hypermetric saccades
- Progressive loss of vision
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene TPP1: tripeptidyl peptidase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/tpp1
Dante Labs. Gene TPP1: tripeptidyl peptidase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/tpp1
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