Geen
TPP1
tripeptidyl peptidase 1
- HGNC 2073↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000166340↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1200↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p15.4
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 6 612 768–6 619 422 (GRCh38)
- Eksonid
- 13 eksonit, ulatus 6,7 kb
- Valk
- 563 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- LPIC, TPP-1
- Varasemad tähised
- CLN2, SCAR7
- MANE Select transkript
- ENST00000299427.12NM_000391.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe TPP1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Neuronaalne tseroid-lipofutsinoos
- Autosoomne retsessiivne
Pärilike progresseeruvate degeneratiivsete ajuhaiguste rühm, mida kliiniliselt iseloomustavad vaimsete ja muude võimete langus, epilepsia ning võrkkesta degeneratsiooni tõttu tekkiv nägemise kadu, ja histopatoloogiliselt autofluorestseeruva aine, tseroid-lipofutsiini, rakusisene kogunemine ajus ja võrkkestas asuvates neuronaalsetes rakkudes.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 7 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Autosomaalselt retsessiivsed tserebellaarsed ataksiad (sh CANVAS ja AVED)
- Autosomaalselt retsessiivne tserebellaarne ataksiaAutosoomne retsessiivne
Üks 57 sellega seotud geenist
Retsessiivselt pärandunud ataksiate rühm, mida põhjustavad bialleelsed variandid geenides nagu RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 ja SYNE1.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
E-vitamiini puudulikkusega ataksiat (TTPA) saab ravida E-vitamiini lisanditega; teisi vorme ravitakse füsioteraapia ja sümptomite leevendamisega ning lähisugulastele saab pakkuda kandjatesti.
Lüsosomaalne ladustamishaigus
- Lüsosomaalne ladustamishaigus (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 59 sellega seotud geenist
Hõlmab lüsosomaalseid ladustamishaigusi, millel ei ole eraldi raportit, näiteks Farberi tõbe ja muid ASAH1-ga seotud häireid, prosaposiini (PSAP) puudulikkusi, multipelset sulfataasi puudulikkust, mukopolüsahharidoosi tüüpe IX ja X ning Dorfman-Chanarini tõbe; pärilikkuse muster sõltub alatüübist, kõige sagedamini autosomaal-retsessiivne.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 7 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas TPP1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,5 kb kogupikkusega 6,7 kb; neist 1692 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse TPP1
146
kohad geenis TPP1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TPP1 6,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,5 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Jagab 2 haigust
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninJagab 2 haigust
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseJagab 2 haigust
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinJagab 2 haigust
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinJagab 2 haigust
- CTSDcathepsin DJagab 2 haigust
- CTSFcathepsin FJagab 2 haigust
- CYP27A1cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1Jagab 2 haigust
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Jagab 2 haigust
- GRNgranulin precursorJagab 2 haigust
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Jagab 2 haigust
- MFSD8major facilitator superfamily domain containing 8Jagab 2 haigust
Geeniga TPP1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TPP1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Degeneration of cerebellum
- Explosive speech
- Lack of coordination of movement
- Truncal titubation
- Unsteady walk
- Postural tremor
- Progressive cerebellar ataxia
Näita veel 18 tunnust
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Clumsiness
- Difficulty articulating speech
- Impaired vibratory sensation
- Increased reflexes
- Limb ataxia
- Progressive gait ataxia
- Wide based walk
- Inability to coordinate movements when walking
- Abnormal nervous system electrophysiology
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Increased extraneuronal autofluorescent lipopigment
- Increased neuronal autofluorescent lipopigment
- Jerking
- Loss of developmental milestones
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Oculomotor apraxia
- Double vision
- Horizontal nystagmus
- Saccadic smooth pursuit interruptions
- Uncoordinated eye movement
- Hypermetric saccades
- Progressive loss of vision
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TPP1 geen: tripeptidyl peptidase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tpp1
Dante Labs. TPP1 geen: tripeptidyl peptidase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tpp1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast