Gén
PAX8
paired box 8
- HGNC 8622↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000125618↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 7849↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 2q14.1
- Koordináták
- 2. kromoszóma: 113 215 997–113 278 921 (GRCh38)
- Exonok
- 12 exon, összesen 62,9 kb
- Fehérje
- 450 aminosav
- Más néven ismert
- PAX-8
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000429538.8NM_003466.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pax8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PAX8-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Congenital Hypothyroidism
A thyroid hormone deficiency present from birth.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Thyroid Cancer
- Hypothyroidism
Abnormally low levels of thyroid hormone.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Thyroid Gland Disorder
A disease involving the thyroid gland.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A PAX8 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 62,9 kb-jából 4,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1353 bázis kódolja a fehérjét.
PAX8 szekvenálása
12
a PAX8 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a PAX8 mind a 62,9 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 4,1 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (12)
The PAX8 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 2
- Valószínűleg patogén 10
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_003466.4(PAX8):c.322C>T (p.Arg108Ter) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.191+1G>A (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.936dup (p.Glu313fs) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.928G>T (p.Glu310Ter) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.898+1G>C (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.637_638dup (p.Gln213fs) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.398G>A (p.Arg133Gln) (opens in a new tab) | congenital hypothyroidism and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.268_270del (p.Glu90del) (opens in a new tab) | congenital hypothyroidism | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.205G>A (p.Gly69Ser) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.203C>T (p.Thr68Ile) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.160A>T (p.Ser54Cys) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_003466.4(PAX8):c.91C>T (p.Arg31Cys) (opens in a new tab) | hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 2 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- DUOX2dual oxidase 23 betegséget oszt meg
- DUOXA2dual oxidase maturation factor 23 betegséget oszt meg
- IGSF1immunoglobulin superfamily member 13 betegséget oszt meg
- IRS4insulin receptor substrate 43 betegséget oszt meg
- IYDiodotyrosine deiodinase3 betegséget oszt meg
- NKX2-5NK2 homeobox 53 betegséget oszt meg
- SECISBP2SECIS binding protein 23 betegséget oszt meg
- SLC26A4solute carrier family 26 member 43 betegséget oszt meg
- SLC26A7solute carrier family 26 member 73 betegséget oszt meg
- SLC5A5solute carrier family 5 member 53 betegséget oszt meg
- TBL1Xtransducin beta like 1 X-linked3 betegséget oszt meg
- TGthyroglobulin3 betegséget oszt meg
A(z) PAX8 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PAX8 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal thyroid location
- Elevated circulating thyroid-stimulating hormone concentration
- Underactive thyroid
- Abnormality of the thyroid gland
- Decreased circulating T4 concentration
- Lingual thyroid
- Small thyroid gland
- Thyroid agenesis
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PAX8 gén: paired box 8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pax8
Dante Labs. PAX8 gén: paired box 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pax8
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt