Gén
IRS4
insulin receptor substrate 4
- HGNC 6128↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000133124↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 8471↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xq22.3
- Koordináták
- X. kromoszóma: 108 719 946–108 736 563 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 16,6 kb
- Fehérje
- 1256 aminosav
- Más néven ismert
- PY160, IRS-4
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000372129.4NM_001379150.1
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/irs4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a IRS4-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Congenital Hypothyroidism
A thyroid hormone deficiency present from birth.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Thyroid Cancer
- Hypothyroidism
Abnormally low levels of thyroid hormone.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Thyroid Gland Disorder
A disease involving the thyroid gland.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A IRS4 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 16,6 kb-jából 6,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3771 bázis kódolja a fehérjét.
IRS4 szekvenálása
3Alacsony
Mennyire nehéz a IRS4 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy IRS4 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.12%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.14%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
1
a IRS4 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a IRS4 gén mind a 16,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 6,6 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- DUOX2dual oxidase 23 betegséget oszt meg
- DUOXA2dual oxidase maturation factor 23 betegséget oszt meg
- IGSF1immunoglobulin superfamily member 13 betegséget oszt meg
- IYDiodotyrosine deiodinase3 betegséget oszt meg
- NKX2-5NK2 homeobox 53 betegséget oszt meg
- PAX8paired box 83 betegséget oszt meg
- SECISBP2SECIS binding protein 23 betegséget oszt meg
- SLC26A4solute carrier family 26 member 43 betegséget oszt meg
- SLC26A7solute carrier family 26 member 73 betegséget oszt meg
- SLC5A5solute carrier family 5 member 53 betegséget oszt meg
- TBL1Xtransducin beta like 1 X-linked3 betegséget oszt meg
- TGthyroglobulin3 betegséget oszt meg
A(z) IRS4 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) IRS4 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). IRS4 gén: insulin receptor substrate 4. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/irs4
Dante Labs. IRS4 gén: insulin receptor substrate 4 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/irs4
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt