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Gène

SETD5

SET domain containing 5

Résumé

Localisation cytogénétique
3p25.3
Coordonnées
Chromosome 3 : 9 397 615–9 478 154 (GRCh38)
Exons
23 exons sur 80,5 kb
Protéine
1 442 acides aminés
Aussi appelé
FLJ10707, SETD5A
Transcrit MANE Select
ENST00000402198.7NM_001080517.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de SETD5

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de SETD5. SETD5 et 20 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 8 937 885 à 9 937 884.Chromosome 33p25.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q299 Mb9,2 Mb9,4 Mb9,6 Mb9,8 MbRAD18 : 8 775 402–8 963 773, brin inverseRAD18SRGAP3 : 8 980 591–9 363 053, brin inverseSRGAP3THUMPD3 : 9 362 967–9 389 323, brin directTHUMPD3SETD5 : 9 397 615–9 478 154, brin directSETD5LHFPL4 : 9 498 361–9 553 862, brin inverseLHFPL4MTMR14 : 9 649 307–9 702 394, brin directMTMR14CPNE9 : 9 703 691–9 729 908, brin directCPNE9BRPF1 : 9 731 726–9 748 019, brin directBRPF1OGG1 : 9 749 938–9 791 067, brin directOGG1CAMK1 : 9 757 341–9 770 606, brin inverseCAMK1TADA3 : 9 779 964–9 793 011, brin inverseTADA3ARPC4 : 9 792 484–9 807 704, brin directARPC4ARPC4-TTLL3 : 9 793 082–9 835 401, brin directTTLL3 : 9 808 086–9 856 087, brin directTTLL3RPUSD3 : 9 831 633–9 844 602, brin inverseCIDEC : 9 864 169–9 891 008, brin inverseCIDECJAGN1 : 9 890 569–9 894 349, brin directJAGN1IL17RE : 9 902 612–9 916 402, brin directIL17REIL17RC : 9 917 040–9 933 630, brin directIL17RC : 9 917 116–9 945 385, brin directCRELD1 : 9 933 791–9 945 413, brin directSchéma de SETD5 : 23 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 6 : 3 sites connus associés à une maladieExon 7 : 4 sites connus associés à une maladieExon 8 : 8 sites connus associés à une maladieExon 9 : 10 sites connus associés à une maladieExon 10 : 11 sites connus associés à une maladieExon 11 : 5 sites connus associés à une maladieExon 12 : 6 sites connus associés à une maladieExon 13 : 3 sites connus associés à une maladieExon 14 : 19 sites connus associés à une maladieExon 15 : 13 sites connus associés à une maladieExon 16 : 9 sites connus associés à une maladieExon 17 : 7 sites connus associés à une maladieExon 18 : 4 sites connus associés à une maladieExon 19 : 13 sites connus associés à une maladieExon 20 : 9 sites connus associés à une maladieExon 21 : 4 sites connus associés à une maladieExon 23 : 4 sites connus associés à une maladieExon 1 : 9 397 615–9 397 977, 363 basesExon 2 : 9 424 467–9 424 526, 60 basesExon 3 : 9 428 823–9 429 009, 187 basesExon 4 : 9 433 845–9 433 950, 106 basesExon 5 : 9 434 334–9 434 485, 152 basesExon 6 : 9 434 824–9 434 882, 59 basesExon 7 : 9 435 728–9 435 906, 179 basesExon 8 : 9 440 456–9 440 698, 243 basesExon 9 : 9 441 593–9 441 741, 149 basesExon 10 : 9 442 128–9 442 245, 118 basesExon 11 : 9 443 308–9 443 417, 110 basesExon 12 : 9 445 048–9 445 300, 253 basesExon 13 : 9 445 657–9 445 740, 84 basesExon 14 : 9 447 050–9 447 307, 258 basesExon 15 : 9 447 686–9 448 006, 321 basesExon 16 : 9 448 388–9 448 630, 243 basesExon 17 : 9 453 739–9 453 868, 130 basesExon 18 : 9 464 425–9 464 672, 248 basesExon 19 : 9 470 459–9 470 929, 471 basesExon 20 : 9 473 236–9 473 537, 302 basesExon 21 : 9 474 449–9 474 582, 134 basesExon 22 : 9 475 068–9 475 156, 89 basesExon 23 : 9 475 483–9 478 154, 2 672 bases15101520235′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 6,9 kb sur les 80,5 kb du gène ; 4 329 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit SETD5

    147

    positions dans SETD5 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 80,5 kb de SETD5, introns compris, et pas seulement les 6,9 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène SETD5 : SET domain containing 5. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/setd5

    Vancouver

    Dante Labs. Gène SETD5 : SET domain containing 5 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/setd5

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