Gen
SETD5
SET domain containing 5
- HGNC 25566↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000168137↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 55209↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3p25.3
- Koordinater
- Kromosom 3: 9 397 615–9 478 154 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner på 80,5 kb
- Protein
- 1 442 aminosyror
- Även känd som
- FLJ10707, SETD5A
- MANE Select-transkript
- ENST00000402198.7NM_001080517.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SETD5, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Intellektuell funktionsnedsättning
En av 233 gener kopplade till den
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är SETD5 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6,9 kb av genens 80,5 kb, och 4 329 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SETD5
147
positioner i SETD5 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 80,5 kb av SETD5, med introner inräknade, inte bara de 6,9 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Delar 1 tillstånd
- ADKadenosine kinaseDelar 1 tillstånd
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDelar 1 tillstånd
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Delar 1 tillstånd
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Delar 1 tillstånd
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ANK3ankyrin 3Delar 1 tillstånd
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Delar 1 tillstånd
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Delar 1 tillstånd
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SETD5
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SETD5 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Bulbous nose
- Downturned corners of mouth
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Wide nasal bridge
- Corners of eye widely separated
- Little lower jaw
- Abnormally small head
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Broad head shape
- Cleft palate
- Dental crowding
- Depressed nasal bridge
- Drooling
- Eye folds
- High palate
- Monobrow
- Nasal tip, upturned
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Decreased volume of lip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- High forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Pit in front of the ear
- Short neck
- Triangular face
- Smooth philtrum
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Cognitive impairment
- Delayed speech and language development
- Autism spectrum disorder
- Obsessive compulsive behavior
- Epilepsy
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SETD5-genen: SET domain containing 5. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/setd5
Dante Labs. SETD5-genen: SET domain containing 5 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/setd5
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor