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Gène

JAGN1

jagunal vesicle mediated transporter 1

Résumé

Localisation cytogénétique
3p25.3
Coordonnées
Chromosome 3 : 9 890 610–9 894 349 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 3,7 kb
Protéine
183 acides aminés
Aussi appelé
GL009, FLJ14602
Transcrit MANE Select
ENST00000647897.1NM_032492.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de JAGN1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de JAGN1. JAGN1 et 30 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 9 392 480 à 10 392 479.Chromosome 33p25.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q299,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbSETD5 : 9 397 609–9 479 240, brin directSETD5LHFPL4 : 9 498 361–9 553 862, brin inverseLHFPL4MTMR14 : 9 649 307–9 702 394, brin directMTMR14CPNE9 : 9 703 691–9 729 908, brin directCPNE9BRPF1 : 9 731 726–9 748 019, brin directBRPF1OGG1 : 9 749 938–9 791 067, brin directOGG1CAMK1 : 9 757 341–9 770 606, brin inverseTADA3 : 9 779 964–9 793 011, brin inverseARPC4 : 9 792 484–9 807 704, brin directARPC4ARPC4-TTLL3 : 9 793 082–9 835 401, brin directARPC4-TTLL3TTLL3 : 9 808 086–9 856 087, brin directTTLL3RPUSD3 : 9 831 633–9 844 602, brin inverseRPUSD3CIDEC : 9 864 169–9 891 008, brin inverseCIDECJAGN1 : 9 890 610–9 894 349, brin directJAGN1IL17RE : 9 902 612–9 916 402, brin directIL17REIL17RC : 9 917 040–9 933 630, brin directIL17RC : 9 917 116–9 945 385, brin directCRELD1 : 9 933 791–9 945 413, brin directPRRT3 : 9 939 450–9 952 442, brin inverseEMC3 : 9 957 217–10 011 202, brin inverseEMC3FANCD2 : 10 026 370–10 101 937, brin directFANCD2FANCD2OS : 10 081 317–10 108 290, brin inverseFANCD2OSBRK1 : 10 115 590–10 135 082, brin directBRK1VHL : 10 141 764–10 153 676, brin directVHLIRAK2 : 10 164 862–10 243 756, brin directIRAK2TATDN2 : 10 248 023–10 281 218, brin directTATDN2 : 10 249 042–10 249 366, brin direct : 10 249 372–10 285 796, brin directGHRL : 10 285 666–10 292 959, brin inverseGHRLSEC13 : 10 293 131–10 321 207, brin inverseSEC13ATP2B2 : 10 324 023–10 708 060, brin inverseATP2B2Schéma de JAGN1 : 2 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 1 : 5 sites connus associés à une maladieExon 2 : 3 sites connus associés à une maladieExon 1 : 9 890 610–9 890 811, 202 basesExon 2 : 9 892 915–9 894 349, 1 435 bases125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 3,7 kb du gène ; 552 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de JAGN1

8

positions de JAGN1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 3,7 kb de JAGN1, introns compris, et pas seulement les 1,6 kb d'exons.

Gènes liés aux mêmes affections

Traits associés à JAGN1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que JAGN1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène JAGN1 : jagunal vesicle mediated transporter 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/jagn1

Vancouver

Dante Labs. Gène JAGN1 : jagunal vesicle mediated transporter 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/jagn1

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