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Gène

GLI1

GLI family zinc finger 1

Résumé

Localisation cytogénétique
12q13.3
Coordonnées
Chromosome 12 : 57 459 785–57 472 268 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 12,5 kb
Protéine
1 106 acides aminés
Symboles précédents
GLI
Transcrit MANE Select
ENST00000228682.7NM_005269.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GLI1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GLI1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de GLI1. GLI1 et 41 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 56 966 027 à 57 966 026.Chromosome 1212q13.3p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3357 Mb57,2 Mb57,4 Mb57,6 Mb57,8 MbACKR5 : 56 994 487–56 998 889, brin directACKR5ZBTB39 : 56 998 836–57 006 560, brin inverseZBTB39TAC3 : 57 010 000–57 028 883, brin inverseTAC3MYO1A : 57 025 262–57 051 198, brin inverseMYO1ANEMP1 : 57 055 641–57 088 063, brin inverseNEMP1NAB2 : 57 088 883–57 095 476, brin directNAB2STAT6 : 57 095 403–57 132 139, brin inverseSTAT6LRP1 : 57 128 476–57 213 394, brin directLRP1NXPH4 : 57 216 780–57 226 449, brin directSHMT2 : 57 226 554–57 234 935, brin directCOXFA4L2 : 57 234 541–57 242 750, brin inverseCOXFA4L2STAC3 : 57 243 453–57 251 195, brin inverseSTAC3 : 57 249 609–57 296 484, brin inverseR3HDM2 : 57 253 762–57 431 051, brin inverseR3HDM2INHBC : 57 434 700–57 452 067, brin directINHBCINHBE : 57 452 323–57 459 280, brin directINHBEGLI1 : 57 459 785–57 472 268, brin directGLI1ARHGAP9 : 57 472 260–57 488 831, brin inverseARHGAP9MARS1 : 57 475 445–57 517 702, brin directMARS1DDIT3 : 57 516 584–57 523 630, brin inverseDDIT3 : 57 517 712–57 520 480, brin inverseMBD6 : 57 520 710–57 530 614, brin directDCTN2 : 57 529 567–57 547 256, brin inverseKIF5A : 57 546 026–57 586 633, brin directKIF5APIP4K2C : 57 591 161–57 603 418, brin directPIP4K2CDTX3 : 57 604 484–57 609 804, brin directDTX3ARHGEF25 : 57 610 111–57 617 245, brin directARHGEF25 : 57 615 280–57 626 125, brin directB4GALNT1 : 57 623 409–57 633 242, brin inverseOS9 : 57 693 841–57 728 342, brin directOS9AGAP2 : 57 723 761–57 742 209, brin inverseAGAP2TSPAN31 : 57 738 013–57 751 383, brin directTSPAN31CDK4 : 57 746 043–57 756 013, brin inverseCDK4MARCHF9 : 57 754 940–57 760 411, brin directCYP27B1 : 57 762 334–57 768 986, brin inverseMETTL1 : 57 768 471–57 772 131, brin inverseEEF1AKMT3 : 57 771 492–57 782 544, brin direct : 57 772 660–57 797 554, brin directTSFM : 57 782 731–57 828 655, brin directTSFMAVIL : 57 797 376–57 818 734, brin inverseAVILCTDSP2 : 57 819 925–57 846 976, brin inverseCTDSP2ATP23 : 57 906 039–57 959 148, brin directATP23Schéma de GLI1 : 12 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 2 sites connus associés à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 57 459 785–57 460 201, 417 basesExon 2 : 57 463 665–57 463 791, 127 basesExon 3 : 57 463 999–57 464 091, 93 basesExon 4 : 57 464 673–57 464 868, 196 basesExon 5 : 57 465 111–57 465 255, 145 basesExon 6 : 57 465 607–57 465 696, 90 basesExon 7 : 57 465 788–57 465 925, 138 basesExon 8 : 57 466 240–57 466 389, 150 basesExon 9 : 57 467 333–57 467 497, 165 basesExon 10 : 57 467 994–57 468 224, 231 basesExon 11 : 57 469 431–57 469 698, 268 basesExon 12 : 57 470 317–57 472 268, 1 952 bases1234567891011125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4 kb sur les 12,5 kb du gène ; 3 321 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GLI1

7

positions dans GLI1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 12,5 kb de GLI1, introns compris, et pas seulement les 4 kb d'exons.

Traits associés à GLI1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que GLI1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GLI1 : GLI family zinc finger 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gli1

Vancouver

Dante Labs. Gène GLI1 : GLI family zinc finger 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gli1

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