Genă
GLI1
GLI family zinc finger 1
- HGNC 4317↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000111087↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 2735↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 12q13.3
- Coordonate
- Cromozomul 12: 57.459.785–57.472.268 (GRCh38)
- Exoni
- 12 de exoni pe 12,5 kb
- Proteină
- 1.106 de aminoacizi
- Simboluri anterioare
- GLI
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000228682.7NM_005269.3
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gli1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți GLI1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă GLI1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei GLI1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 4 kb din cei 12,5 kb ai genei; 3.321 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere GLI1
7
poziții în GLI1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
Un genom complet acoperă toți cei 12,5 kb ai GLI1, inclusiv intronii, nu doar cei 4 kb de exoni.
ClinVar pathogenic variants (7)
The GLI1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenă 3
- Probabil patogenă 4
| Variantă | Conditions | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_005269.3(GLI1):c.337C>T (p.Arg113Ter) (opens in a new tab) | polydactyly, postaxial, type A8 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.1013G>T (p.Cys338Phe) (opens in a new tab) | polydactyly, postaxial, type A8 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.2340G>A (p.Trp780Ter) (opens in a new tab) | polydactyly, postaxial, type A8 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.816G>T (p.Trp272Cys) (opens in a new tab) | polydactyly, postaxial, type A8 | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.985A>T (p.Lys329Ter) (opens in a new tab) | polydactyly, postaxial, type A8 | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.1138C>T (p.Arg380Ter) (opens in a new tab) | polydactyly of a biphalangeal thumb and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_005269.3(GLI1):c.2797_2798insA (p.Gly933fs) (opens in a new tab) | polydactyly of a biphalangeal thumb and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
Trăsături asociate cu GLI1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca GLI1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal heart valve morphology
- Hole in center of heart
- All organs on wrong side of body
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.18-8b139e39.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena GLI1: GLI family zinc finger 1. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/gli1
Dante Labs. Gena GLI1: GLI family zinc finger 1 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/gli1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni