Gène
FOXN1
forkhead box N1
- HGNC 12765↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000109101↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 8456↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 17q11.2
- Coordonnées
- Chromosome 17 : 28 506 348–28 538 900 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons sur 32,6 kb
- Protéine
- 648 acides aminés
- Hérédité
- Autosomique récessif
- Aussi appelé
- FKHL20
- Symboles précédents
- WHN, RONU
- Transcrit MANE Select
- ENST00000579795.6NM_001369369.1
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Déficit immunitaire combiné sévère
- Autosomique récessif
Le déficit immunitaire combiné sévère (DICS) regroupe un ensemble de déficits immunitaires primitifs rares d'origine monogénique. Il se caractérise par l'absence de lymphocytes T périphériques fonctionnels, ce qui entraîne dès les premiers mois de vie des infections respiratoires sévères ainsi qu'un retard de croissance staturo-pondérale. Ces déficits sont classés selon leur phénotype immunologique : les DICS avec absence de lymphocytes T mais présence de lymphocytes B (DICS T-B+) et les DICS avec absence de ces deux types de cellules (DICS T-B-). Chacun de ces groupes comprend plusieurs formes, associées ou non à la présence de cellules tueuses naturelles (NK).
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Regroupements plus larges
Autres erreurs innées de l'immunité
- Déficit immunitaire
L'un des 170 gènes qui lui sont liés
Maladie caractérisée par une déficience ou une anomalie des mécanismes de l'immunité, qu'elle soit cellulaire ou humorale.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
HSCT pour le SCID et les DIP sévères ; traitement substitutif par immunoglobulines (IVIG/SCIG) pour les déficits en anticorps ; leniolisib (Joenja, FDA 2023) pour l'APDS ; thérapie génique pour l'ADA-SCID ; abatacept pour le déficit en CTLA4/LRBA ; antibioprophylaxie ; G-CSF pour la CGD
Transmission
- Autosomique récessif
- Il faut une copie modifiée provenant de chacun des parents. Avec une seule, vous êtes porteur et généralement non atteint ; lorsque les deux parents sont porteurs, chaque enfant a une chance sur quatre d'hériter de deux copies.
Structure de FOXN1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
- Variants avec une page
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3,5 kb sur les 32,6 kb du gène ; 1 947 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit FOXN1
70
positions dans FOXN1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 32,6 kb de FOXN1, introns compris, et pas seulement les 3,5 kb d'exons.
Variants avec une page (29)
Les variants FOXN1 disposant d'une page ici, ceux avec le plus d'étoiles de révision en premier. Chaque page décrit le dossier public de ClinVar sur le variant, jamais un résultat.
| Variant | HGVS c. | Exon ou intron | Position (GRCh38) | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|---|---|
| C82X | c.246C>A | Exon 3 | 28 524 625 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| D313Tfs*169 | c.933_936dup | Exon 7 | 28 534 334 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E303Sfs*247 | c.907del | Exon 6 | 28 530 823 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E390Kfs*160 | c.1168del | Exon 8 | 28 534 738 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| G337Efs*213 | c.1010del | Exon 7 | 28 534 411 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| H321R | c.962A>G | Exon 7 | 28 534 365 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| H457Pfs*93 | c.1370del | Exon 8 | 28 534 940 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| I433Ffs*117 | c.1296del | Exon 8 | 28 534 863 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| L325P | c.974T>C | Exon 7 | 28 534 377 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| L426Tfs*123 | c.1275_1278del | Exon 8 | 28 534 840 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
Gènes liés aux mêmes affections
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- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexPartage 2 affections
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- CORO1Acoronin 1APartage 2 affections
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CPartage 2 affections
Traits associés à FOXN1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que FOXN1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the immune system
- Recurrent viral infections
- Cellular immunodeficiency
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Severe T-cell immunodeficiency
- Autoimmunity
- Opportunistic infection
- Pneumonia
Afficher 15 traits supplémentaires
- Recurrent bacterial infections
- Severe infection
- Severe viral infection
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Invasive fungal infection
- Meningitis
- Recurrent Candida infection
- Recurrent Staphylococcus aureus infection
- Recurrent streptococcus pneumoniae infections
- Pus-filled lesion
- Recurrent infections in bronchi and lungs
- Recurrent pneumonia
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène FOXN1 : forkhead box N1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/foxn1
Dante Labs. Gène FOXN1 : forkhead box N1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/foxn1
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