Gen
FOXN1
forkhead box N1
- HGNC 12765↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000109101↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 8456↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 17q11.2
- Współrzędne
- Chromosom 17: 28 506 348–28 538 900 (GRCh38)
- Eksony
- 9 eksonów na odcinku 32,6 kb
- Białko
- 648 aminokwasów
- Znany również jako
- FKHL20
- Poprzednie symbole
- WHN, RONU
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000579795.6NM_001369369.1
- Typ locus
- Protein-coding
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/foxn1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj FOXN1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Ciężki złożony niedobór odporności
- Autosomalne recesywne
Ciężki złożony niedobór odporności (SCID) obejmuje grupę rzadkich, jednogenowych pierwotnych niedoborów odporności, które charakteryzują się brakiem funkcjonalnych limfocytów T obwodowych. Prowadzi to do ciężkich infekcji dróg oddechowych pojawiających się we wczesnym dzieciństwie oraz do zahamowania prawidłowego wzrostu i rozwoju. Ze względu na fenotyp immunologiczny wyróżnia się SCID z brakiem komórek T przy zachowanych komórkach B (SCID T-B+) oraz SCID z brakiem zarówno komórek T, jak i B (SCID T-B-). Obie te grupy obejmują kilka postaci, z obecnością lub bez komórek NK (natural killer).
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Szersze grupy
Inne wrodzone błędy odporności
- Niedobór odporności
Jeden z 170 powiązanych z nim genów
Choroba, w której dochodzi do niedoboru lub wady mechanizmów odporności, komórkowej lub humoralnej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
HSCT w przypadku SCID i ciężkich pierwotnych niedoborów odporności; substytucja immunoglobulinami (IVIG/SCIG) w przypadku niedoborów przeciwciał; leniolisib (Joenja, FDA 2023) w APDS; terapia genowa w ADA-SCID; abatacept w niedoborze CTLA4/LRBA; profilaktyczne antybiotyki; G-CSF w CGD
Budowa genu FOXN1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,5 kb z 32,6 kb genu; 1947 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie FOXN1
70
pozycje w genie FOXN1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, w którym krótkie odczyty mają trudności.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 32,6 kb genu FOXN1, łącznie z intronami, a nie tylko 3,5 kb eksonów.
Warianty z podstroną (29)
Warianty FOXN1 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| C82X | c.246C>A | Ekson 3 | 28 524 625 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| D313Tfs*169 | c.933_936dup | Ekson 7 | 28 534 334 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| E303Sfs*247 | c.907del | Ekson 6 | 28 530 823 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| E390Kfs*160 | c.1168del | Ekson 8 | 28 534 738 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| G337Efs*213 | c.1010del | Ekson 7 | 28 534 411 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| H321R | c.962A>G | Ekson 7 | 28 534 365 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| H457Pfs*93 | c.1370del | Ekson 8 | 28 534 940 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| I433Ffs*117 | c.1296del | Ekson 8 | 28 534 863 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| L325P | c.974T>C | Ekson 7 | 28 534 377 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| L426Tfs*123 | c.1275_1278del | Ekson 8 | 28 534 840 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADAadenosine deaminaseWspólnych schorzeń: 2
- AK2adenylate kinase 2Wspólnych schorzeń: 2
- BCL11BBCL11 transcription factor BWspólnych schorzeń: 2
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Wspólnych schorzeń: 2
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Wspólnych schorzeń: 2
- CD247CD247 moleculeWspólnych schorzeń: 2
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexWspólnych schorzeń: 2
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexWspólnych schorzeń: 2
- CD70CD70 moleculeWspólnych schorzeń: 2
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorWspólnych schorzeń: 2
- CORO1Acoronin 1AWspólnych schorzeń: 2
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CWspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem FOXN1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać FOXN1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the immune system
- Recurrent viral infections
- Cellular immunodeficiency
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Severe T-cell immunodeficiency
- Autoimmunity
- Opportunistic infection
- Pneumonia
Pokaż jeszcze 15 cech
- Recurrent bacterial infections
- Severe infection
- Severe viral infection
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Invasive fungal infection
- Meningitis
- Recurrent Candida infection
- Recurrent Staphylococcus aureus infection
- Recurrent streptococcus pneumoniae infections
- Pus-filled lesion
- Recurrent infections in bronchi and lungs
- Recurrent pneumonia
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen FOXN1: forkhead box N1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/foxn1
Dante Labs. Gen FOXN1: forkhead box N1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/foxn1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni