Gen
FOXN1
forkhead box N1
- HGNC 12765↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000109101↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 8456↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q11.2
- Koordinater
- Kromosom 17: 28 506 348–28 538 900 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 32,6 kb
- Protein
- 648 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- FKHL20
- Tidigare symboler
- WHN, RONU
- MANE Select-transkript
- ENST00000579795.6NM_001369369.1
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs FOXN1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Svår kombinerad immunbrist
- Autosomalt recessiv
Svår kombinerad immunbrist (SCID) omfattar en grupp sällsynta, monogena primära immunbristsjukdomar som kännetecknas av brist på fungerande perifera T-lymfocyter. Det leder till allvarliga luftvägsinfektioner med tidig debut och tillväxtsvikt. Sjukdomarna klassificeras efter immunologisk fenotyp i SCID med avsaknad av T-celler men närvaro av B-celler (T-B+ SCID) eller SCID med avsaknad av båda (T-B- SCID). Båda grupperna omfattar flera former, med eller utan naturliga dödarceller (NK-celler).
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är FOXN1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,5 kb av genens 32,6 kb, och 1 947 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest FOXN1
70
positioner i FOXN1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 32,6 kb av FOXN1, med introner inräknade, inte bara de 3,5 kb exoner.
Varianter med egen sida (29)
De FOXN1-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| C82X | c.246C>A | Exon 3 | 28 524 625 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| D313Tfs*169 | c.933_936dup | Exon 7 | 28 534 334 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| E303Sfs*247 | c.907del | Exon 6 | 28 530 823 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| E390Kfs*160 | c.1168del | Exon 8 | 28 534 738 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| G337Efs*213 | c.1010del | Exon 7 | 28 534 411 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| H321R | c.962A>G | Exon 7 | 28 534 365 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| H457Pfs*93 | c.1370del | Exon 8 | 28 534 940 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| I433Ffs*117 | c.1296del | Exon 8 | 28 534 863 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| L325P | c.974T>C | Exon 7 | 28 534 377 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| L426Tfs*123 | c.1275_1278del | Exon 8 | 28 534 840 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 2 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 2 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 2 tillstånd
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Delar 2 tillstånd
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Delar 2 tillstånd
- CD247CD247 moleculeDelar 2 tillstånd
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDelar 2 tillstånd
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDelar 2 tillstånd
- CD70CD70 moleculeDelar 2 tillstånd
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDelar 2 tillstånd
- CORO1Acoronin 1ADelar 2 tillstånd
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDelar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till FOXN1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som FOXN1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the immune system
- Recurrent viral infections
- Cellular immunodeficiency
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Severe T-cell immunodeficiency
- Autoimmunity
- Opportunistic infection
- Pneumonia
Visa ytterligare 15 egenskaper
- Recurrent bacterial infections
- Severe infection
- Severe viral infection
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Invasive fungal infection
- Meningitis
- Recurrent Candida infection
- Recurrent Staphylococcus aureus infection
- Recurrent streptococcus pneumoniae infections
- Pus-filled lesion
- Recurrent infections in bronchi and lungs
- Recurrent pneumonia
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). FOXN1-genen: forkhead box N1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/foxn1
Dante Labs. FOXN1-genen: forkhead box N1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/foxn1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor