Gen
RLBP1
retinaldehyde binding protein 1
- HGNC 10024↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000140522↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6017↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 15q26.1
- Koordinater
- Kromosom 15: 89 209 869–89 221 579 (GRCh38)
- Eksoner
- 9 eksoner over 11,7 kb
- Protein
- 317 aminosyrer
- Også kjent som
- CRALBP
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000268125.10NM_000326.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rlbp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes RLBP1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Medfødt stasjonær nattblindhet
- Fundus albipunctatusAutosomal recessiv
En form for stasjonær nattblindhet, vanligvis forårsaket av endringer i begge kopier av RDH5, med mange små hvite prikker i netthinnen og langsom tilvenning til mørket.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Å kjenne årsaken hjelper til å unngå feildiagnostisering som progressiv netthinnedystrofi.
Arvelige makuladystrofier
- PRPH2-relatert retinopatiAutosomal dominant
En netthinnetilstand forårsaket av endringer i PRPH2, som kan gi mønsterdystrofi, vitelliform dystrofi hos voksne eller mer omfattende netthinnedegenerasjon, også innen samme familie.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Regelmessige øyeundersøkelser bidrar til å oppdage komplikasjoner og støtter planlegging av oppfølging.
RDH5-relatert retinopati (Fundus albipunctatus)
- Autosomal recessiv
Forårsaket av endringer i begge kopier av RDH5, et enzym i synssyklusen som regenererer det lysfølsomme pigmentet i fotoreseptorene. Endringene antas å gjøre pigmentregenereringen langsommere, slik at øynene bruker mye lengre tid på å tilpasse seg mørke.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Regelmessige øyeundersøkelser for å følge med på eventuell påvirkning av macula eller tappcellene, og råd om håndtering av nattsyn. Foreldrene er vanligvis bærere, så bærertesting av slektninger og genetisk veiledning er tilgjengelig.
Retinitis pigmentosa
- RLBP1-relatert retinopatiAutosomal recessiv
En retinal dystrofi forårsaket av endringer i RLBP1-genet.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er RLBP1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,6 kb av genets 11,7 kb, og 954 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av RLBP1
1Lett
Hvor vanskelig RLBP1 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til RLBP1 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til RLBP1 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.2,9 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.0 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til RLBP1 i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
24
posisjoner i RLBP1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helgenomsekvensering dekker alle 11,7 kb av RLBP1, inkludert introner, ikke bare de 1,6 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (24)
The RLBP1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 10
- Sannsynligvis patogen 14
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000326.5(RLBP1):c.677T>A (p.Met226Lys) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 5 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000326.5(RLBP1):c.452G>A (p.Arg151Gln) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000326.5(RLBP1):c.282del (p.Phe95fs) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000326.5(RLBP1):c.286_297del (p.Phe96_Phe99del) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 3 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000326.5(RLBP1):c.25C>T (p.Arg9Cys) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 3 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_000326.5(RLBP1):c.700C>T (p.Arg234Trp) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.504_508del (p.Ser168fs) (opens in a new tab) | mitochondrial DNA depletion syndrome 4a | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.466C>T (p.Arg156Ter) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.346G>C (p.Gly116Arg) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.255_258dup (p.Arg87fs) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.141G>A (p.Lys47=) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.12+1G>A (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.832del (p.Gln278fs) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.753C>A (p.Tyr251Ter) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.685-2A>G (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.602T>C (p.Ile201Thr) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.451C>T (p.Arg151Trp) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.437G>A (p.Gly146Asp) (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.341T>C (p.Leu114Pro) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.256G>T (p.Glu86Ter) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.203del (p.Glu68fs) (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.141+2T>C (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.13-1G>C (opens in a new tab) | retinitis pigmentosa | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_000326.5(RLBP1):c.12+2del (opens in a new tab) | Bothnia retinal dystrophy and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til RLBP1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene RLBP1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the eye
- Abnormal color vision
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Abnormal dark-adapted electroretinogram
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal light- and dark-adapted electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Absent foveal reflex
Vis 48 egenskaper til
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Increased OCT-measured foveal thickness
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Partial loss of field of vision
- Progressive loss of vision
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Undetectable dark-adapted electroretinogram
- Visual impairment
- Yellow/white retinal lesion
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal foveal morphology
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormality of refraction
- Blind spot located at fixation point
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Macular degeneration
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Pigmentary retinopathy
- Posterior subcapsular cataract
- Progressive visual field defects
- Retinal atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Retinitis
- Ring scotoma
- Abnormal choroid morphology
- Abnormal fundus pigmentation
- ERG: Reduced dark-adapted b-wave amplitude
- Large central loss of field of vision
- Lenticonus
- Macular atrophy
- Paracentral scotoma
- Photopsia
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Fundus albipunctatus
- Retinal flecks
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-19: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.19-9814e911.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RLBP1-genet: retinaldehyde binding protein 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rlbp1
Dante Labs. RLBP1-genet: retinaldehyde binding protein 1 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rlbp1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker