Gen
CACNA1G
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G
- HGNC 1394↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000006283↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 8913↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 17q21.33
- Coördinaten
- Chromosoom 17: 50.560.715–50.627.474 (GRCh38)
- Exons
- 38 exons over 66,8 kb
- Eiwit
- 2.377 aminozuren
- Ook bekend als
- Cav3.1, NBR13
- MANE Select-transcript
- ENST00000359106.10NM_018896.5
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cacna1g.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees CACNA1G en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Autosomale dominante cerebellaire ataxieën (SCA's en DRPLA)
- Autosomale dominante cerebellaire ataxieAutosomaal dominant
Een groep dominant overerfbare ataxieën, waaronder SCA1, SCA2, SCA3 (ziekte van Machado-Joseph), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B en DRPLA, veroorzaakt door herhalingsexpansies of puntvarianten in genen zoals ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 en FGF14.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Genetische counseling en presymptomatisch onderzoek voor familieleden, fysiotherapie en symptoombehandeling; sommige vormen, zoals SCA27B, kunnen reageren op specifieke medicatie.
Bredere groeperingen
Erfelijke neurodegeneratieve aandoeningen
- Met KIF5A samenhangende neurodegeneratieve aandoeningAutosomaal dominant
Een van 372 genen die hiermee verband houden
Veroorzaakt door veranderingen in één kopie van KIF5A, een motoreiwit met een staart die vracht bindt. Verschillende soorten veranderingen leiden tot verschillende aandoeningen: hereditaire spastische paraplegie type 10, een axonale vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth en amyotrofe laterale sclerose (ALS).
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
De zorg is symptomatisch en hangt af van het ziektebeeld; zij omvat fysiotherapie, medicijnen tegen spasticiteit en multidisciplinaire ALS-zorg. Elk kind van een aangedane persoon heeft een kans van 1 op 2 om de verandering te erven; erfelijkheidsadvies helpt gezinnen dit te begrijpen.
Opbouw van CACNA1G
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 8,6 kb van de 66,8 kb van het gen; 7.134 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van CACNA1G
11Makkelijk
Hoe moeilijk CACNA1G is te sequencen met korte reads, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van CACNA1G liggen op plaatsen waar korte reads correct worden uitgelijnd.
Wat dit verergert: het aandeel van de exonen van CACNA1G in elk type moeilijke regio
- MapbaarheidStukken waar reads van 100 of 250 bp niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 100 krijgen.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- Gedeeld met chrYDe pseudoautosomale regio's en de X-getransponeerde regio, waar chrX en chrY dezelfde of bijna dezelfde sequentie bevatten, zodat een read van de ene op de andere kan worden geplaatst. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- ReferentiedekkingHiaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 50 krijgen.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 30 krijgen.4,9%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding slechts dun worden gedekt. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 20 krijgen.49%
Een Dante Labs-score op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt er gescoordElke balk is het aandeel van de exonbasen van CACNA1G in dat type moeilijke regio. Elk type kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra type voegt steeds minder toe: 0 wanneer geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 wanneer elke base ligt waar reads niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst.
16
posities in CACNA1G waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen ervan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een heel genoom dekt alle 66,8 kb van CACNA1G, inclusief de introns, en niet alleen de 8,6 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (16)
The CACNA1G variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 3
- Waarschijnlijk pathogeen 13
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_018896.5(CACNA1G):c.2881G>A (p.Ala961Thr) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.4591A>G (p.Met1531Val) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.5144G>A (p.Arg1715His) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.481A>T (p.Ile161Phe) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.632T>C (p.Leu211Pro) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.2549C>T (p.Ala850Val) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.2810C>T (p.Ser937Leu) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.3476G>A (p.Arg1159His) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.3787T>G (p.Ser1263Ala) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.3835G>A (p.Asp1279Asn) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.4180C>T (p.Arg1394Trp) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits and 1 other | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.4592T>C (p.Met1531Thr) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.4593G>A (p.Met1531Ile) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.4931A>T (p.Lys1644Met) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits and 1 other | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.5543C>G (p.Ala1848Gly) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_018896.5(CACNA1G):c.5960_5961delinsAC (p.Thr1987Asn) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 42 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Deelt 2 aandoeningen
- ATN1atrophin 1Deelt 2 aandoeningen
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deelt 2 aandoeningen
- ATXN1ataxin 1Deelt 2 aandoeningen
- ATXN10ataxin 10Deelt 2 aandoeningen
- ATXN2ataxin 2Deelt 2 aandoeningen
- ATXN3ataxin 3Deelt 2 aandoeningen
- ATXN7ataxin 7Deelt 2 aandoeningen
- BEAN1brain expressed associated with NEDD4 1Deelt 2 aandoeningen
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeelt 2 aandoeningen
- CAMTA1calmodulin binding transcription activator 1Deelt 2 aandoeningen
- DAB1DAB adaptor protein 1Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan CACNA1G
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die CACNA1G kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Delayed fine motor development
- Delayed motor skills
- Delayed social development
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Lack of coordination of movement
Toon 29 kenmerken meer
- Abnormality of the cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Neurodevelopmental abnormality
- Unsteady walk
- Babinski sign
- Cerebellar vermis atrophy
- Degeneration of cerebellum
- Depression
- Epilepsy
- Eyelid myokymia
- Impaired vibration sensation at ankles
- Inability to coordinate movements when walking
- Small cerebellum
- Alzheimer disease
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Dystonia
- Head tremor
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Multifocal epileptiform discharges
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Resting tremor
- Tremor
- Upper limb postural tremor
- Abnormal pyramidal sign
- Cognitive impairment
- Loss of Purkinje cells in the cerebellar vermis
- Spastic ataxia
Abnormality of the eye
- Cross-eyed
- Gaze-evoked horizontal nystagmus
- Oculomotor apraxia
- Saccadic smooth pursuit interruptions
- Deeply set eye
- Double vision
- Farsightedness
- Hypometric saccades
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-19: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.19-9814e911.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). CACNA1G-gen: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G. Geraadpleegd op 20 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/cacna1g
Dante Labs. CACNA1G-gen: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G [Internet]. [geraadpleegd 20 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/cacna1g
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken