Genas
TOPORS
TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase
- HGNC 21653↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000197579↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 10210↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 9p21.1
- Koordinatės
- Chromosoma 9: 32 540 544–32 552 586 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 12 kb
- Baltymas
- 1 045 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- TP53BPL, LUN
- Ankstesni simboliai
- RP31
- MANE Select transkriptas
- ENST00000360538.7NM_005802.5
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/topors.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite TOPORS ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Retinitis pigmentosa
- Su TOPORS susijusi retinopatija
Tinklainės distrofija, kurią sukelia TOPORS geno pokyčiai.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Vienas iš 77 su juo susijusių genų
Paveldimų tinklainės distrofijų grupė, kuriai būdingas progresuojantis lazdelių, o vėliau kolbelių fotoreceptorių netekimas, sukeliantis naktinį aklumą ir palaipsnį periferinio regėjimo praradimą.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas TOPORS
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,1 kb iš 12 kb geno; 3 138 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: TOPORS
10
vietos geno TOPORS sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 12 kb geno TOPORS, įskaitant intronus, o ne tik 4,1 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Turi 1 bendrą būklę
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Turi 1 bendrą būklę
- AHRaryl hydrocarbon receptorTuri 1 bendrą būklę
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Turi 1 bendrą būklę
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinTuri 1 bendrą būklę
- ARL3ARF like GTPase 3Turi 1 bendrą būklę
- ARL6ARF like GTPase 6Turi 1 bendrą būklę
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Turi 1 bendrą būklę
- BEST1bestrophin 1Turi 1 bendrą būklę
- CA4carbonic anhydrase 4Turi 1 bendrą būklę
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ATuri 1 bendrą būklę
- CDHR1cadherin related family member 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su TOPORS
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti TOPORS, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
Rodyti dar 23 savybių
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Inward turning cross eyed
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Wide-set eyes
- Abnormal color vision
- Decreased clarity of vision
- Photopsia
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Ataxia
- Global developmental delay
- Hypoplasia of olfactory tract
- Intellectual disability
- Molar tooth sign on MRI
- Abnormality of neuronal migration
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
Rodyti dar 4 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). TOPORS genas: TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/topors
Dante Labs. TOPORS genas: TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/topors
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites