Genas
SIX1
SIX homeobox 1
- HGNC 10887↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000126778↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6495↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 14q23.1
- Koordinatės
- Chromosoma 14: 60 643 421–60 649 477 (GRCh38)
- Eksonai
- 2 eksonų per 6,1 kb
- Baltymas
- 284 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Ankstesni simboliai
- DFNA23
- MANE Select transkriptas
- ENST00000645694.3NM_005982.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite SIX1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Branchio-oto-renaliniu spektro sutrikimas
- Branchio-oto-renalinis spektro sutrikimasAutosominis dominantinis
Dominuojanti būklė, daugiausia sukeliama EYA1, SIX1 ar SIX5 genų pokyčių, pasireiškianti laidumo, jutimo nervo ar mišria klausos negalia, ausų vystymosi anomalijomis, kaklo cistomis ar duobutėmis, o kai kuriems žmonėms – inkstų anomalijomis.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Žinojimas apie šią būklę padeda planuoti klausos tyrimus ir inkstų ultragarsinę stebėseną bei padeda šeimai gauti konsultaciją.
Vrođene anomalije bubrega i mokraćnog trakta
- Branhio-oto-renalni sindromAutosominis dominantinis
Stanje uzrokovano varijantama u EYA1 ili SIX1 koje zahvaćaju vrat, uši i sluh te bubrege.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Saznanje potiče procjenu sluha i snimanje bubrega.
Klausos ir kurtumas
- Autosominis dominantinis nesindrominis klausos sutrikimasAutosominis dominantinis
Autosominė dominantinė nesindrominio kurtumo forma.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Nesindrominė paveldima klausos netekimas
Vienas iš 97 su juo susijusių genų
Paveldimas klausos netekimas be kitų medicininių požymių, įskaitant dažniausias recesyvines formas, kurias sukelia GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ir daugelis kitų genų, taip pat dominantines, X chromosomai susietas ir mitochondrines formas.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Žinojimas apie genetinę priežastį gali padėti priimti sprendimus dėl klausos pagalbos ir kochlearinio implanto, nustatyti tinkamumą genų terapijos tyrimams (pavyzdžiui, OTOF) bei suteikti konsultacijas šeimai.
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas SIX1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4 kb iš 6,1 kb geno; 855 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito SIX1
20
SIX1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 6,1 kb SIX1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ACTG1actin gamma 1Turi 2 bendrų būklių
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ATuri 2 bendrų būklių
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Turi 2 bendrų būklių
- CD164CD164 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentTuri 2 bendrų būklių
- COCHcochlinTuri 2 bendrų būklių
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainTuri 2 bendrų būklių
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainTuri 2 bendrų būklių
- DIAPH1diaphanous related formin 1Turi 2 bendrų būklių
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Turi 2 bendrų būklių
- GJB2gap junction protein beta 2Turi 2 bendrų būklių
- GJB6gap junction protein beta 6Turi 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su SIX1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SIX1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the ear
- Abnormality of the inner ear
- Abnormality of the middle ear
- Hearing impairment
- Abnormality of the middle ear ossicles
- Abnormality of the outer ear
- Abnormally shaped ears
- Absent ear canal
- Absent/small cochlea
Rodyti dar 15 savybių
- Conductive deafness
- Cupped ear
- Enlarged cochlear aqueduct
- Enlarged vestibular aqueduct
- Hypoplasia of the cochlea
- Lop ear
- Middle ear malformation
- Mixed hearing impairment
- Narrow ear canal
- Sensorineural hearing impairment
- Abnormal lateral semicircular canal morphology
- Incomplete partition of the cochlea type II
- Small ears
- Cholesteatoma
- Dilatated internal auditory canal
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SIX1 genas: SIX homeobox 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/six1
Dante Labs. SIX1 genas: SIX homeobox 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/six1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites