Gen
SIX1
SIX homeobox 1
- HGNC 10887↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000126778↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6495↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 14q23.1
- Koordinater
- Kromosom 14: 60.643.421–60.649.477 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner fordelt over 6,1 kb
- Protein
- 284 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Tidligere symboler
- DFNA23
- MANE Select-transkript
- ENST00000645694.3NM_005982.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs SIX1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Branchio-Oto-Renalt Spektrum-syndrom
- Autosomal dominant
En dominant tilstand, som hovedsagelig skyldes ændringer i EYA1, SIX1 eller SIX5, og som medfører konduktivt, sensorineuralt eller blandet høretab, misdannelser af ørerne, cyster eller fistler i halsen og hos nogle personer nyreanomalier.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden om tilstanden giver anledning til høreundersøgelse og overvågning med nyreultralyd og er til hjælp ved familierådgivning.
Medfødte misdannelser af nyrer og urinveje
- Branchio-oto-renalt syndromAutosomal dominant
En tilstand forårsaget af varianter i EYA1 eller SIX1, der påvirker halsen, ørerne og hørelsen samt nyrerne.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden giver anledning til hørevurdering og billeddiagnostik af nyrerne.
Høretab og døvhed
- Autosomalt dominant ikke-syndromalt høretabAutosomal dominant
Autosomalt dominant form for ikke-syndromal døvhed.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Ikke-syndromal genetisk høretab
Et af 97 gener, der er knyttet til det
Arvelig høretab uden andre medicinske træk, herunder de hyppige recessive former forårsaget af GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC og mange andre gener, samt dominante, X-bundne og mitokondrielle former.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden om den genetiske årsag kan vejlede valget af høreapparat og cochleaimplantat, berettigelse til genterapiforsøg (for eksempel OTOF) og familierådgivning.
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er SIX1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4 kb af genets 6,1 kb; 855 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest SIX1
20
positioner i SIX1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 6,1 kb af SIX1, inklusive introner, og ikke kun de 4 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACTG1actin gamma 1Deler 2 sygdomme
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeler 2 sygdomme
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deler 2 sygdomme
- CD164CD164 moleculeDeler 2 sygdomme
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeler 2 sygdomme
- COCHcochlinDeler 2 sygdomme
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainDeler 2 sygdomme
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainDeler 2 sygdomme
- DIAPH1diaphanous related formin 1Deler 2 sygdomme
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Deler 2 sygdomme
- GJB2gap junction protein beta 2Deler 2 sygdomme
- GJB6gap junction protein beta 6Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til SIX1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SIX1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the ear
- Abnormality of the inner ear
- Abnormality of the middle ear
- Hearing impairment
- Abnormality of the middle ear ossicles
- Abnormality of the outer ear
- Abnormally shaped ears
- Absent ear canal
- Absent/small cochlea
Vis 15 træk mere
- Conductive deafness
- Cupped ear
- Enlarged cochlear aqueduct
- Enlarged vestibular aqueduct
- Hypoplasia of the cochlea
- Lop ear
- Middle ear malformation
- Mixed hearing impairment
- Narrow ear canal
- Sensorineural hearing impairment
- Abnormal lateral semicircular canal morphology
- Incomplete partition of the cochlea type II
- Small ears
- Cholesteatoma
- Dilatated internal auditory canal
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SIX1-genet: SIX homeobox 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/six1
Dante Labs. SIX1-genet: SIX homeobox 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/six1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger