Gene
LCA5
lebercilin LCA5
- HGNC 31923↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000135338↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 167691↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 6q14.1
- Coordinate
- Cromosoma 6: 79.484.991–79.537.430 (GRCh38)
- Esoni
- 8 esoni su 52,4 kb
- Proteina
- 697 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Simboli precedenti
- C6orf152
- Trascritto MANE Select
- ENST00000369846.9NM_001122769.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Amaurosi congenita di Leber e retinopatia correlata a RPE65
- Amaurosi congenita di LeberAutosomica recessiva
Un gruppo di distrofie retiniche ereditarie, causate da alterazioni di geni come CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 e AIPL1, che determinano una grave perdita della vista, nistagmo e risposte pupillari ridotte già nella prima infanzia.
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
La conferma del gene può determinare l'idoneità a trattamenti genospecifici e sperimentazioni cliniche, e orienta la consulenza familiare.
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di LCA5
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 4,6 kb dei 52,4 kb del gene; 2094 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge LCA5
86
posizioni in LCA5 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 52,4 kb di LCA5, introni inclusi, non solo i 4,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneCondivide 1 condizione
- CCT2chaperonin containing TCP1 subunit 2Condivide 1 condizione
- CEP290centrosomal protein 290Condivide 1 condizione
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Condivide 1 condizione
- CRXcone-rod homeoboxCondivide 1 condizione
- GUCY2Dguanylate cyclase 2D, retinalCondivide 1 condizione
- IMPDH1inosine monophosphate dehydrogenase 1Condivide 1 condizione
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Condivide 1 condizione
- LRATlecithin retinol acyltransferaseCondivide 1 condizione
- NMNAT1nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1Condivide 1 condizione
- PRPH2peripherin 2Condivide 1 condizione
- RD3RD3 regulator of GUCY2DCondivide 1 condizione
Tratti collegati a LCA5
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che LCA5 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the eye
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Marked vision impairment
- Abnormal color vision
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
Mostra altri 30 tratti
- Bulging cornea
- Clouding of the lens of the eye
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Farsightedness
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Spicular pigmentation of the retina
- Undetectable electroretinogram
- Visual impairment
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Outward facing eye ball
- Posterior subcapsular cataract
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Severe farsightedness
- Visual loss
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene LCA5: lebercilin LCA5. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lca5
Dante Labs. Gene LCA5: lebercilin LCA5 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lca5
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